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DataLad 科学数据管理工具
datalad
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
434
DataLad 基于 Git 和 git-annex 管理科学数据集,高效处理大文件,将内容远程存储。它能记录计算溯源,确保分析可复现,支持从 OpenNeuro 等仓库克隆、获取和发布数据集。适用于管理大型数据文件及保证分析流程的可重复性。
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NCATS ARAX 生物医学知识图谱查询
ncats-arax
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
250
该技能用于查询 NCATS Translator ARAX API,获取生物医学知识图谱关系。支持基于 Biolink 约束的一跳和两跳查询、实体归一化及提供者联邦。用户可检查溯源和边绑定。仅限公开研究查询,需 Python 3.10+ 及 HTTPS 访问。不可用于临床指导或敏感数据。
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病原体变异监测
pathogen-variant-surveillance
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
360
通过 GenSpectrum LAPIS API 查询实时病原体基因组监测数据,识别当前循环的病毒谱系、增长速率及突变。适用于确定 SARS-CoV-2 优势变异株或流感谱系等当前病原体状态,确保超越静态知识截止的准确性。支持多种病原体分析。
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药代动力学与药效学建模
pkpd-modeling
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
141
该技能用于药代动力学和药效学建模,包括非房室分析、房室拟合及群体药代分析。通过 Python 脚本推导暴露指标、评估给药方案并预测药物相互作用,适用于分析浓度 - 时间数据,支持临床药理学工作流程。
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RELSA严重程度评估与人道终点预测
relsa-severity-assessment
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
345
将体重变化、体温、临床评分、生物标志物等动物福利指标整合为每只动物每天的RELSA综合严重度评分,并通过核密度估计划定关注区与危险区,结合ARIMA模型预测人道终点,服务于3R原则与动物福利报告。
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Folklore变异证据检索
folklore-variant-evidence
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
83
通过 Folklore 临床变异解读 MCP,检索公开的 ClinGen 基因-疾病有效性断言,以及针对单个 GRCh38 胚系 SNV 或简单 indel 的来源链接证据,并对解析状态进行确定性分支处理。
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