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材料结构分析工具包

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Pymatgen 通过 Python 构建、转换和分析晶体结构，支持多种文件格式、能带和相图评估，并可调用材料项目数据库，适用于高通量材料计算工作流。

Pymoo 多目标优化框架

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Pymoo 是一个 Python 多目标优化框架，提供 NSGA-II/III、MOEA/D 等算法、可定制遗传操作、标准测试集与可视化工具，帮助工程设计在冲突目标下寻找 Pareto 解并处理约束问题。

Pysam 基因组工具集

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Pysam 提供 htslib 的 Python 绑定，读取/写入 SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ，查询区域、计算覆盖度并支持 samtools/bcftools，便于构建 NGS 数据分析流程。

QuTiP 量子工具箱

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QuTiP 是面向研究与教学的 Python 量子模拟库，提供求解器、物理量分析、可视化及高级算法，适合研究开放系统、Lindblad 动力学、退相干与量子光学场景。

RDKit 化学信息学工具

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RDKit 提供 Python 接口读取/写入 SMILES/SDF/InChI，控制分子规范化，计算描述符与指纹，执行子结构搜索、化学反应与可视化，适用于药物发现与计算化学研究。

微生物组生物信息工具包

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scikit-bio 是一款 Python 生物数据工具库，涵盖序列处理、比对、系统发育树、微生物多样性指标、群落统计与排序分析，适用于需要处理 FASTA/Newick 文件与生态多样性统计的研究流程。

敏感数据清零审计工具

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检测源代码中敏感数据的清零缺失及编译器优化抹除问题，依赖汇编/IR 证据，辅助审计 C/C++/Rust 的密钥、密码等逻辑，结合数据流、控制流与运行验证完成安全核查。

Pyzotero Zotero 管理工具

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Pyzotero 利用 Zotero Web API v3 让 Python 脚本可读写库中的条目、集合、标签及附件，便于自动化生成引文、上传 PDF 和构建与 Zotero 集成的科研流程。

Apify Actor 化流程指南

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Actorization 通过将现有项目封装为 Apify Actor，添加 SDK 生命周期、输入输出 Schema，使用 `apify run` 本地测试并 `apify push` 部署，让命令行工具或脚本在 Apify 平台上成为可重用的无服务器自动化应用。

Apify电商数据提取

apify-ecommerce

sickn33/antigravity-awesome-skills

通过 Apify 电商抓取工具集中提取商品信息、价格、卖家与评论数据，支持价格监控、评论分析和卖家追踪等多种场景。

MCP 服务器生成器

mcp-server-builder

alirezarezvani/claude-skills

通过 OpenAPI 合约生成 MCP 服务器脚手架，涵盖工具清单、验证、版本与运行时选择，帮助 Python/TypeScript 代理快速上线稳定 API。

性能分析与优化指南

performance-profiler

alirezarezvani/claude-skills

性能分析与优化工具为 Node.js、Python 和 Go 应用提供 CPU、内存、包体和数据库瓶颈定位，生成 flamegraph 与包分析报告，并结合 k6 或 Artillery 压测验证改动效果，强调先量测后优化。

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