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Biopython分子生物工具包
biopython
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
303
Biopython 提供序列操作、数据库访问、BLAST 自动化、结构生物信息和系统发育等功能,适合用于编写定制流水线和批量处理的计算分子生物学任务。
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统一生物信息查询工具
gget
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
489
gget 提供命令行和 Python 接口,统一访问 20 多个生物信息数据库,可交互或脚本化查询基因、序列、BLAST、结构与富集等信息。
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Latch 生物信息工作流
latchbio-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
264
LatchBio Integration 提供 Python 为核心的服务器化生物信息流程构建与部署能力,涵盖装饰器任务、LatchFile/Dir 云存储、GPU 资源调优,以及与 Nextflow/Snakemake 等管道的互通,适合 RNA-seq、AlphaFold 等分析场景。
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生物信息多数据库Python接口
bioservices
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
497
统一的 Python 接口访问 40+ 生物信息学数据库与服务,支持跨库查询、ID 映射、序列比对和通路分析,适合整合多来源生物数据的工作流。
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Latch 生信工作流集成
latchbio-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
252
在 Latch 平台上使用 Python SDK、CLI、Nextflow、Snakemake、Latch Data、Registry 和 MCP 构建、注册、调试与运行生物信息学工作流,涵盖资源配置、数据管理、界面表单和任务监控。
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Linktree生产环境检查清单
linktree-prod-checklist
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
195
本清单旨在为Linktree API集成提供全面的生产环境加固指南。内容涵盖安全密钥管理、限流机制、强大的错误恢复逻辑(如熔断器和指数退避),以及关键的监控和安全实践,例如Webhook签名验证。使用本清单确保在流量高峰期,链接生物信息页面的数据准确性、系统持续可用性和性能表现。
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Nextflow数据管道开发
nextflow
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
140
构建、运行和调试Nextflow数据管道与nf-core工作流。支持可复现的科学/生物信息学工作流,可扩展至HPC/云,并使用nf-test测试模块。
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Biopython:生物计算工具箱
biopython
sickn33/antigravity-awesome-skills
425
Biopython是一个全面的Python库,专为计算分子生物学而设计。它提供了处理生物序列(DNA、RNA、蛋白质)、结构分析(PDB)、序列比对、系统发育树构建以及与NCBI等主要公共数据库交互的强大功能。适用于进行高级生物信息学分析的研究人员。
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OpenMed医疗生物医学NLP开发指南
building-with-openmed
maziyarpanahi/openmed
356
本技能是使用OpenMed构建临床和生物医学NLP管线的综合指南。OpenMed是一个本地优先的Python库,用于执行实体识别(NER)、受保护的健康信息(PHI)脱敏和FHIR导出,所有操作均在设备本地运行,无需网络调用。当您开始新的临床文本项目,需要选择合适的OpenMed能力(如零样本NER、审计或FHIR转换),或需要核心功能入口时,请使用本指南。
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