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Biopython分子生物工具包

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

Biopython 提供序列操作、数据库访问、BLAST 自动化、结构生物信息和系统发育等功能，适合用于编写定制流水线和批量处理的计算分子生物学任务。

COBRApy 代谢建模分析

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

COBRApy 是面向系统生物学和代谢工程的 Python 工具，支持加载 SBML/JSON/YAML 模型、执行 FBA/FVA/采样、分析基因或反应敲除，并探索培养基与产物相位平面。

单细胞RNA速度分析

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

scVelo是一款用于分析单细胞RNA测序数据的RNA速度分析工具。它通过建模mRNA剪接的动力学（利用未剪接和剪接的mRNA比例），推断细胞状态转变和发育轨迹。该工具可用于预测细胞命运、识别分化路径和找出驱动基因，是进行单细胞生物学研究的强大补充。

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