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bioRxiv 预印本搜索

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通过关键词、作者、日期和类别筛选 bioRxiv 预印本，输出结构化 JSON 元数据并可下载 PDF，便于文献综述与研究趋势追踪。

ClinVar 变异临床意义查询

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查询ClinVar数据库以获取变异临床意义，通过网页/API访问、FTP批量下载并注释VCF，辅助基因组医学解读。

DrugBank 数据洞察

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提供 DrugBank 的药物与靶点数据访问，涵盖数据下载、信息查询、药物相互作用网络、靶点与通路分析以及化学相似性比较，支持药理研究与临床安全评估。

GEO基因表达提取器

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连接NCBI GEO仓库，通过Entrez搜索GSE/GSM/GPL/Profiles，获取基因表达数据、实验设计和矩阵文件，配合GEOparse下载分析所需的转录组资料。

人类代谢物数据库查询

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通过 HMDB 检索 22 万余条人类代谢物信息，可按名称、ID、结构、疾病、标本筛选，获取化学、临床、通路和谱图数据并批量下载，支持代谢组学研究与生物标志物分析。

癌症影像数据访问

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通过 idc-index 查询并下载 NCI Imaging Data Commons 的公开癌症影像数据，按元数据筛选、获取 DICOM 文件、浏览序列并确认许可，方便 AI 训练与科研使用。

PDB结构浏览器

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通过 RCSB PDB 搜索蛋白或核酸结构、下载 PDB/mmCIF/Binary 坐标文件、获取实验元数据并批量处理，为药物发现、蛋白工程和结构生物学提供数据支撑。

UniProt数据库接口

uniprot-database

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通过 UniProt REST API 搜索蛋白质、获取 FASTA 与注释、执行 ID 映射并流式下载，适合 Python 工作流和批量分析。

BindingDB 亲和力查询

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通过 BindingDB 的 REST 接口或下载表格获取药物-靶标的 Ki/Kd/IC50/EC50 亲和力数据，辅助靶点驱动的药物发现、SAR 分析、先导化合物评估和基准数据集构建。

DepMap 依赖数据探索

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通过 DepMap 查询癌细胞系的 CRISPR Chronos 依赖评分、药物敏感性与基因效应，辅助靶点验证、生物标志物发现与合成致死研究，可用 API 或批量下载进行分析。

PowerShell脚本块日志分析

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mukul975/Anthropic-Cybersecurity-Skills

用于安全事件调查和威胁狩猎的取证工具。它能解析Windows PowerShell事件ID 4104（脚本块日志），重构被截断的脚本，并应用高级检测机制，以识别混淆代码、Base64编码、下载凭空和AMSI绕过等恶意攻击行为，支持安全运营中心进行深度溯源分析。

学术论文搜索与下载

wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep

一个全面的学术论文处理工具，可根据主题或ID在arXiv上搜索、下载学术论文。它能提取详细元数据（包括摘要、作者、分类），并支持将PDF文件保存到本地库，是研究人员和学生高效获取科学文献的理想助手。

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