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基因组区间机器学习工具箱

geniml
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
208
Geniml是一个用于在基因组区间数据（BED文件）上进行机器学习分析的Python工具包。它提供了一系列先进的无监督方法，用于学习基因组区域、单细胞（scATAC-seq）和元数据的嵌入表示。核心功能包括Region2Vec、BEDspace、scEmbed等，支持构建共识峰集（Universe），可用于基因组学研究中的聚类和特征提取。
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神经像素高密度记录分析

neuropixels-analysis
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
167
这是一个用于分析神经像素高密度神经记录的端到端工具箱，覆盖了完整的电生理学工作流程。功能包括加载多种数据格式、预处理、漂移/运动校正、高级尖峰排序（如Kilosort4）以及单元精修（包括AI辅助）。适用于处理多节、高通道数的神经数据分析。
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DICOM医学影像处理工具

pydicom
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
138
用于处理DICOM医学影像文件，支持读取、写入和修改医学图像数据。功能包括提取CT、MRI等各类医学扫描的像素数据，管理复杂的元数据标签，处理数据压缩，执行患者数据匿名化，并能将医学图像转换为标准格式，适用于医疗影像分析和PACS系统集成。
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Hex CI/CD 集成指南

hex-ci-integration
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
323
用于配置Hex数据分析项目的CI/CD流程，支持通过GitHub Actions实现自动化测试和部署验证。它可以在每次PR时运行单元测试，并在合并到main分支时触发实时的Hex项目运行，确保数据转换逻辑和仪表板刷新流程的可靠性。
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癌症影像数据查询与下载

imaging-data-commons
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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该工具通过`idc-index`库，支持查询和下载国家癌症研究所（NCI）的公开癌症影像数据集。用户可以根据元数据筛选、可视化并下载DICOM文件，广泛应用于大规模AI模型训练和医学科研。
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系统文献综述生成器

literature-review
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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用于执行系统化、全面的文献综述。该工具指导用户完成从确定研究范围、制定检索策略到综合分析研究结果的整个过程。它能够整合多数据库的学术资料，生成包含专业引用和AI生成科学图表的Markdown或PDF报告。特别适用于撰写学位论文、进行元分析或进行学术研究。
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Foundry本地开发与测试循环

palantir-local-dev-loop
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本指南指导用户搭建Palantir Foundry的本地开发环境。它允许开发者使用PySpark在本地、使用样本数据运行数据转换和单元测试，并通过Mock Foundry API进行集成测试。这确保了代码的快速、独立迭代，适用于构建复杂的ETL数据管道逻辑。
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多引擎搜索与数据提取

serpapi-core-workflow-b
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
300
该工作流利用 SerpApi，支持跨越YouTube、Bing、Google新闻、购物和地图等多个搜索引擎进行高级搜索。它尤其适用于需要聚合来自不同来源（如视频元数据、产品价格、本地商家信息）的爬取、SEO研究或构建复杂搜索功能，获取全面的在线数据。
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Snowflake高级故障排除与性能调优

snowflake-advanced-troubleshooting
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本指南提供一套全面的Snowflake高级故障排除工具集。它深入分析了查询性能剖析、数据溢出检测、锁竞争、交易冲突及元数据操作瓶颈。适用于解决标准方法无法解决的慢查询和性能优化难题。
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系统文献综述与知识综合

systematic-literature-review
bytedance/deer-flow
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本技能用于对某一研究主题进行系统性的文献综述（SLR）。它能够搜索多个学术论文，提取每篇论文的结构化元数据（如研究问题、方法论、核心发现和局限性），并综合这些分散的信息，提炼出整体的学术主题和研究趋势。适用于进行全面的文献调研、撰写注释书目或跨论文比较分析，最终生成符合APA、IEEE等专业格式的报告。
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OpenAlex学术论文检索

openalex
wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep
102
利用OpenAlex API进行全面的学术论文检索。可获取开放的引用图、作者机构隶属关系、项目资金信息等详细元数据。适用于需要进行深入、系统性学术研究的场景。
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综合PDF处理与操作指南

document-skills-pdf
aitytech/agentkits-marketing
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本指南提供了一套完整的PDF处理工具集，涵盖了文本、表格和元数据的提取。用户可以使用Python库（如pypdf, pdfplumber）进行文档合并、拆分、旋转，并利用reportlab创建新的PDF。此外，还结合了命令行工具和OCR流程，支持处理扫描件和复杂的自动化文档流程。
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