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生物数据分析工具包

scikit-bio
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
282
scikit-bio是一个全面的Python库，专为生物信息学和生物数据分析设计。它提供强大的功能，用于处理DNA、RNA和蛋白质序列，执行复杂的序列比对，构建和分析系统发育树，并进行高级的生态学统计。核心能力包括计算多样性度量、进行降维分析（PCoA）以及处理多种生物学文件格式（如FASTA，Newick）。适用于微生物学、基因组学和生态学研究领域。
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scikit-survival：生存时间分析库

scikit-survival
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
272
scikit-survival 是一个基于 scikit-learn 的专业 Python 库，用于进行生存分析和时间-事件建模。它专门处理存在审查数据的场景（如右删失数据），支持拟合 Cox 比例风险模型、随机生存森林和梯度提升模型等多种先进模型。用户可以利用库中的指标（如C-index）评估模型性能，适用于生命周期分析、临床研究和可靠性工程等领域。
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单细胞组学深度生成模型

scvi-tools
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scvi-tools是一个全面的Python框架，利用深度生成模型和变分推断技术，用于分析单细胞数据的多模态组学数据。它特别适用于进行概率性的批次效应校正、多组学数据整合以及带有不确定性的差异表达分析，支持RNA-seq、ATAC-seq和多组学数据。
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Seaborn 统计绘图分析工具

seaborn
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Seaborn是一个功能强大的Python统计绘图库，专为创建出版级别的统计图形而设计。它与pandas数据框深度集成，使用户能够轻松可视化复杂的统计关系、分布和比较（例如箱线图、小提琴图和热力图）。它极大地简化了多元分析和探索性数据分析过程。
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SHAP：模型可解释性与可理解性

shap
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SHAP（Shapley Additive exPlanations）提供基于Shapley值的统一框架，用于深度解释复杂的机器学习模型预测。它可以计算每个特征对模型输出的贡献度，帮助用户理解模型做出判断的依据。本技能支持生成瀑布图、特征重要性热力图等可视化结果，适用于模型可解释性、调试和公平性分析，支持各类模型。
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综合统计分析与报告工具

statistical-analysis
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本工具提供系统化的统计分析流程指导，适用于学术研究和定量分析。它涵盖了从检验假设（t检验、方差分析、回归、相关性）到数据诊断、假设检验、效应量计算，直至生成符合APA格式的专业报告的全过程。帮助用户科学选择合适的统计模型。
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统计建模与计量经济学分析

statsmodels
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这是一个用于Python的专业统计建模库，适用于进行严谨的计量经济学分析。它支持线性回归（OLS）、广义线性模型（GLM）、时间序列预测（ARIMA）等多种模型，提供深入的诊断工具和完整的统计推断报告，支持学术研究和数据分析。
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TimesFM零样本时间序列预测

timesfm-forecasting
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本技能基于Google TimesFM基础模型，实现零样本时间序列预测。无需自定义模型训练，即可处理任何单变量时间序列数据（如销售额、传感器读数等）。它提供点预测和校准的预测区间（分位数），支持完整的概率性分析。使用前会执行强制性系统检查，确保运行环境资源充足。
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美国财库联邦金融数据查询

usfiscaldata
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本工具可连接美国财政部免费的REST API，用于查询全面的联邦金融数据。用户可以使用Python和Pandas提取国家债务、利率、汇率、日财库报告和拍卖数据等关键财务指标。适用于进行专业的金融分析、经济趋势监测和公共财政追踪。
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内存外海量数据分析

vaex
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Vaex是一个高性能的Python库，专为内存外（out-of-core）计算设计，能够处理和可视化超出系统内存限制的超大型表格数据集。它支持高效进行大规模数据筛选、统计聚合、可视化和构建机器学习模型，特别适用于单机环境下的TB级数据分析。
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获取深度金融信号分析

alphaear-deepear-lite
RKiding/Awesome-finance-skills
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该技能连接DeepEar Lite平台，用于实时抓取高频金融信号。它能够提取信号的标题、总结、情绪指标和置信度，提供完整的推理分析。适用于需要获取即时市场趋势、股票表现因子和专业金融分析的场景。
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金融时间序列预测与分析

alphaear-predictor
RKiding/Awesome-finance-skills
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该技能使用Kronos模型执行先进的金融时间序列预测。它首先生成量化基础预测，然后结合新闻情感分析进行调整和优化，是需要获取可操作市场洞察的金融专业人士的必备工具。
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