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Datamol化学信息工具
datamol
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
169
Datamol 提供 rdkit 的 Python 化封装,简化 SMILES/SELFIES/InChI 解析、结构标准化、分子描述符/指纹、聚类、3D 构象、并行批处理及云存储读写等药物发现流程,并保持与 rdkit.Chem.Mol 对象的兼容性。
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TileDB VCF 变体存储
tiledbvcf
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
466
TileDB-VCF 使用 TileDB 稀疏数组高效管理 VCF/BCF 变异数据,支持增量样本、并行区域查询、云本地存储与导出,适合群体基因组分析与变异数据库构建。
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Zarr 云端数组存储
zarr-python
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
499
Zarr 是一款 Python 工具,支持分块压缩、分片以及 NumPy/Dask/Xarray 兼容,适用于并行 I/O 和可扩展的云端科学计算流程。
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Dask 分布式计算
dask
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
361
使用 Dask 实现超内存的 pandas 与 NumPy 并行及分布式计算。适用于大数据集多文件处理、超大 DataFrame/数组运算和非结构化数据清洗,可从单机扩展到集群。
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Datamol 化学信息学工具包
datamol
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
159
基于 RDKit 的 Python 化学信息学封装库,简化分子解析、标准化、描述符与指纹计算、聚类、3D 构象生成及并行药物发现流程,适合标准分子数据处理。
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自主深度研究与报告生成
deep-dive
rohitg00/awesome-claude-code-toolkit
299
这是一个自主的深度研究系统,能够利用有向无环图(DAG)对复杂问题进行规划。它能并行执行多个子问题,进行知识空白分析和迭代,最终综合所有发现,生成结构化、全面的研究报告。适用于深度市场调研、学术文献回顾或需要多源数据支持的复杂问题分析。
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Zarr 分块数组存储
zarr-python
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
382
使用 Zarr-Python 3 存储和处理大规模多维数组,支持分块、压缩与并行 I/O,可通过 fsspec 读写 S3/GCS 等云存储,并兼容 NumPy、Dask 和 Xarray,适用于科学计算流水线。
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TileDB-VCF 基因组变异存储
tiledbvcf
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
250
基于 TileDB 稀疏数组的基因组变异数据存储与查询工具,支持 VCF/BCF 并行摄入、增量添加样本、按基因组区域并行查询及数据导出,适用于群体基因组学与队列研究。
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Polars:高性能数据分析框架
polars
sickn33/antigravity-awesome-skills
324
Polars是一个专为Python和Rust构建的超高性能DataFrame库。它基于Apache Arrow,支持惰性求值(Lazy Evaluation)和并行计算,非常适合构建数据抽取、转换和加载(ETL)管道。它能够高效处理大型数据集,是需要超越Pandas性能瓶颈的数据分析和转换的最佳选择。
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