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LaminDB生物数据平台

lamindb
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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LaminDB 是一款面向生物数据的开放平台，提供从数据集管理、谱系追踪到本体注释、模式校验与工作流集成的全链路能力，帮助科研团队打造可查询、可复现的 FAIR 数据湖仓。
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OpenAlex科研文献数据库

openalex-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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借助 OpenAlex 客户端查询 2.4 亿+ 学术成果，执行文献检索、引用追踪、开放获取发现与计量分析，覆盖论文、作者、机构等实体。
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开放靶点数据库平台

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通过 Open Targets GraphQL API 查询靶点-疾病关联、可成药性、安全性、药物及多组学证据，帮助完成治疗靶点发现、优先级排序、安全评估和药物再利用等工作。
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PubMed 数据库访问

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K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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通过 PubMed 的 REST/API 接口构建布尔、MeSH 查询，按类型和时间等属性过滤文献，并借助 NCBI E-utilities 自动抓取摘要、引用和批量处理。
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TileDB VCF 变体存储

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K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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TileDB-VCF 使用 TileDB 稀疏数组高效管理 VCF/BCF 变异数据，支持增量样本、并行区域查询、云本地存储与导出，适合群体基因组分析与变异数据库构建。
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ZINC 可购化合物数据库

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K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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通过网页或 CartBlanche API 查询 UCSF 维护的 ZINC22 2.3 亿+ 可购化合物，按 ZINC ID、SMILES、供应商或随机抽样获取结构与分子库，辅助虚拟筛选与对接准备。
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BindingDB 亲和力查询

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K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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通过 BindingDB 的 REST 接口或下载表格获取药物-靶标的 Ki/Kd/IC50/EC50 亲和力数据，辅助靶点驱动的药物发现、SAR 分析、先导化合物评估和基准数据集构建。
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cBioPortal癌症基因组数据

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通过 cBioPortal REST API 查询 TCGA、GENIE 等肿瘤研究的突变、拷贝数、表达和生存数据，可用于癌基因验证、共突变模式分析与临床变量关联研究。
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DepMap 依赖数据探索

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通过 DepMap 查询癌细胞系的 CRISPR Chronos 依赖评分、药物敏感性与基因效应，辅助靶点验证、生物标志物发现与合成致死研究，可用 API 或批量下载进行分析。
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君主计划疾病知识库

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K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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通过 Monarch Initiative API 查询跨物种的疾病-基因-表现型关联，用于罕见病基因发现、表现型映射与模型生物数据整合的研究。
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食物营养数据库查询与分析

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sickn33/antigravity-awesome-skills
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本技能提供全面的营养食物数据库查询、比较和计算功能。支持根据食物名称、营养指标（如高蛋白、低GI）进行模糊搜索，并能根据份量、烹饪影响等进行精确营养计算。适用于进行专业化的膳食计划、营养分析，或对比不同食物的宏微量营养差异。
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Hugging Face 数据集查询与分析

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sickn33/antigravity-awesome-skills
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用于对Hugging Face上的数据集进行全面的只读探索、查询和分析。它通过数据集查看器API支持列出数据分割、预览行数据、按文本搜索或过滤记录，并获取数据集的统计信息和Parquet链接。此外，还支持使用SQL（通过parquetlens）进行复杂的深层数据查询和导出，支持CSV、JSON和Parquet格式。
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