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系统发生树构建与分析工具包

phylogenetics
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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本工具包提供完整的系统发生学分析流程，涵盖序列比对、数据精修和树状图构建。集成了MAFFT进行多序列比对，IQ-TREE 2和FastTree进行最大似然树推断。适用于分子基因组学、病毒进化追踪、蛋白质家族分析和分子时钟研究等领域，实现自动化生物信息学分析。
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Polars：高性能数据分析库

polars
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Polars是一个基于Apache Arrow的高性能数据框库，专为Python和Rust设计。它提供惰性计算和表达式API，能够高效处理内存中的数据集。非常适合构建ETL数据管道和进行复杂的数据清洗分析，是比Pandas更快速、更优化的选择。
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PyMC贝叶斯建模与推断

pymc
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本教程详细指导如何使用PyMC库进行复杂的贝叶斯统计建模和概率编程。内容涵盖完整的建模流程，包括数据预处理、MCMC采样（NUTS）、模型诊断检查（如R-hat和ESS）、后验预测以及进行不确定性量化，适用于构建层次模型和时间序列分析。
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Qiskit量子计算框架

qiskit
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Qiskit是一个领先的开源量子计算框架，允许用户构建、优化和执行复杂的量子电路。它支持在本地模拟器和真实的IBM量子硬件等多种平台上运行，是实现量子机器学习、化学模拟和组合优化等高级算法的理想工具。
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生物数据分析工具包

scikit-bio
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scikit-bio是一个全面的Python库，专为生物信息学和生物数据分析设计。它提供强大的功能，用于处理DNA、RNA和蛋白质序列，执行复杂的序列比对，构建和分析系统发育树，并进行高级的生态学统计。核心能力包括计算多样性度量、进行降维分析（PCoA）以及处理多种生物学文件格式（如FASTA，Newick）。适用于微生物学、基因组学和生态学研究领域。
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UMAP降维：可视化与特征提取

umap-learn
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UMAP是一种强大的非线性降维技术，用于可视化高维数据和进行聚类预处理。它能够高效地保留数据的局部和全局结构，并支持监督/半监督学习。该工具适用于数据探索、维度降低以及复杂的机器学习模型构建。
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内存外海量数据分析

vaex
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Vaex是一个高性能的Python库，专为内存外（out-of-core）计算设计，能够处理和可视化超出系统内存限制的超大型表格数据集。它支持高效进行大规模数据筛选、统计聚合、可视化和构建机器学习模型，特别适用于单机环境下的TB级数据分析。
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Apify核心存储与工作流管理

apify-core-workflow-b
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本工具提供对Apify核心存储（数据集、键值存储和请求队列）的全面编程管理能力。它可以执行CRUD操作，实现数据持久化和复杂、多阶段的数据管道编排（例如：爬取→转换→导出）。适用于构建健壮的端到端网络爬取和数据处理自动化工作流。
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Clari营收分析与仪表板

clari-core-workflow-b
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该工作流用于构建基于Clari导出的数据的深度营收分析仪表板。它能够计算关键指标，如预测准确性、销售线索覆盖率和代表业绩变动，帮助财务分析师和销售经理评估营收健康状况和预测可靠性。
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ClickHouse数据导入与管道构建

clickhouse-webhooks-events
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本教程提供了一套构建ClickHouse数据摄取管道的完整解决方案。它涵盖了从多种来源（如HTTP Webhooks、Kafka、S3等）导入数据的最佳实践。内容详细展示了如何实现数据批处理、去重（使用ReplacingMergeTree）以及系统监控，确保数据流的稳定性和可扩展性，适用于构建大型实时数据分析系统。
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ClickHouse数据分析与查询

clickhouse-core-workflow-b
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本技能提供了一套完整的ClickHouse数据处理工作流。它涵盖了高效的批量数据插入、高级分析查询（如漏斗分析、留存分析），以及使用物化视图进行数据预聚合。用户可利用此技能构建高性能的OLAP仪表板和执行大规模数据转换。
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ClickHouse客户端配置与认证

clickhouse-install-auth
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本技能详细指导如何配置和认证官方ClickHouse客户端（支持Node.js和Python）。覆盖了连接ClickHouse Cloud或自建服务器的全部流程，包括环境配置、关键环境参数设置和代码实现，适用于进行数据分析项目或构建数据管道。
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