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数字病理全玻片图像处理库
histolab
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
429
Histolab是一个用于数字病理学领域的全玻片图像(WSI)处理Python库。它能够自动化处理复杂的病理学任务,包括加载多种WSI格式、进行精细的组织区域分割(生成二值掩码),以及从病理切片中提取高质量的、信息丰富的切块。该库支持随机、网格和评分等多重切块策略,非常适合为深度学习模型准备标准化数据集,加速病理研究流程。
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Matchms:质谱相似性与代谢组学分析
matchms
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Matchms是一个功能强大的开源Python库,专用于质谱数据处理和构建分析流程。它可以支持导入多种格式的谱图数据,提供高级过滤功能以标准化数据,并计算多种谱图相似性得分(如余弦相似度)。该工具在代谢物鉴定、谱库搜索和构建可重复的代谢组学流程方面具有极高的应用价值。
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PyTDC:药物发现机器学习数据集
pytdc
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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PyTDC是一个开放科学平台,专门为药物发现和治疗领域提供标准化、可直接用于AI训练的权威数据集和基准。它支持单实例预测(如ADME、毒性)、多实例预测(药物-靶点相互作用DTI)以及分子生成等多种核心任务,是药物机器学习模型开发和性能评估的必备工具。
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单细胞基因组学分析流程
scanpy
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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提供一套完整的单细胞转录组数据分析管线。可用于执行从质量控制、数据标准化、到降维分析(如PCA、UMAP、t-SNE)、聚类识别和标记基因发现的全部流程,是进行探索性单细胞基因组学研究的关键工具。
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神经科学数据结构标准
bids
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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BIDS(脑成像数据结构)是神经科学和生物医学研究数据的社区标准。它定义了一套统一的文件命名和目录结构,用于组织和描述包括MRI、EEG、PET和行为数据在内的多种模态数据。使用本技能可以帮助用户标准化、验证、查询和转换数据,确保数据格式一致性,便于科研分享和分析。
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聚合多搜索引擎查询工具
multi-search-engine
opensquilla/opensquilla
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本技能提供统一的命令行界面,支持同时查询包括Brave、DuckDuckGo、Bing、百度、搜狗和360在内的多个主流搜索引擎。它可以并行执行搜索,并将来自不同源头的结果聚合、标准化为统一的JSON格式。非常适用于深度研究、跨平台事实核查和进行全面的信息对比。
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Power BI模型命名规范化
standardize-naming-conventions
data-goblin/power-bi-agentic-development
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这是一个交互式工作流,用于审计和标准化Power BI语义模型(TMDL文件)中的命名规范。它确保模型中的所有组件(如表、度量值和列)遵循一致、易读且与业务对齐的命名标准。该流程指导用户收集业务背景,生成详细审计报告,并安全地应用跨文件结构修改,包括更新所有内部DAX引用。
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