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ICD-10编码辅助建议系统
coding-icd10
maziyarpanahi/openmed
195
该系统为医疗编码人员提供决策支持,负责将OpenMed提取的诊断和手术过程实体,映射到标准的ICD-10-CM和ICD-10-PCS编码。它能提供候选代码和详细的临床推理,帮助编码人员缩小搜索范围,预填病历,但最终的编码确认必须由专业人工审核。
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定义可计算的表型和队列
defining-cohort-phenotypes
maziyarpanahi/openmed
151
本工具指导使用OHDSI/OMOP CDM构建可计算的病患表型和队列。它允许用户结合标准的概念集(如PheKB)和从临床自由文本中提取的自然语言处理(NLP)特征,定义精确、可执行的筛选标准。特别适用于结构化代码无法捕获的关键健康信息(如症状、社会背景)的分析场景。
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临床文本去标识化处理
deidentifying-clinical-text
maziyarpanahi/openmed
339
本技能用于本地设备上对临床自由文本进行去标识化处理。它可以移除、掩码、替换或哈希敏感的PHI/PII,支持多种方法(如日期偏移)。它确保了在共享、存储或分析医疗记录时,完全保护患者隐私,符合HIPAA和GDPR等严格的隐私标准。
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NLP事实到OMOP数据模型转换
etl-to-omop-cdm
maziyarpanahi/openmed
113
本技能负责执行核心的ETL流程,将OpenMed从文本中提取并编码的临床事实(如疾病、药物、测量值)映射到OMOP通用数据模型(CDM)v5.4。它用于在实体提取和源代码编码之后,将非结构化的NLP发现转换为标准化的、符合OMOP规范的记录,供OHDSI进行深度分析。
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临床实体到FHIR资源提取
extract-clinical-entities-to-fhir
maziyarpanahi/openmed
297
该工具用于从合成或脱敏的临床文本中提取实体。它通过OpenMed识别关键的临床信息跨度,并将这些信息映射为符合FHIR R4标准的结构化资源(如Condition、Observation等)。这实现了实体提取与临床编码的分离,确保输出数据具备标准化和可互操作性。
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提取和处理FHIR R4临床记录
fetching-fhir-resources
maziyarpanahi/openmed
371
该技能用于从FHIR R4电子病历API(如Epic, Cerner)中提取和处理未结构化的临床病历和报告。它负责处理分页查询、解码Base64附件(PDF, TXT)以及提取叙事文本。随后,文本会被传递给OpenMed流程进行符合HIPAA标准的去标识化和自然语言处理分析,从而将原始临床记录转化为可分析的结构化洞察。
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将OpenMed实体链接至UMLS概念
linking-umls-concepts
maziyarpanahi/openmed
161
本技能用于将OpenMed提取的医学实体(如疾病、药物)标准化,并链接到UMLS Metathesaurus的唯一概念标识符(CUI)。它支持跨词典(如SNOMED CT、ICD-10、RxNorm)的概念统一和标准化,是实现概念跨域对齐的核心工具。该流程必须使用用户的UTS API Key,保证数据获取的实时性和安全性。
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将观察值名称映射至LOINC代码
mapping-loinc
maziyarpanahi/openmed
155
本功能用于将自由文本的实验室和临床观察值名称,映射到标准化的LOINC代码。它通过考虑完整的六轴模型(成分、属性、时间、系统、量表、方法),来消歧模糊的术语。通过集成FHIR术语服务,支持US Core实验室结果和UCUM单位,确保代码的准确性和标准化。
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药物提及标准化至RxNorm
normalizing-rxnorm
maziyarpanahi/openmed
463
本技能利用公共RxNav API,将OpenMed提取的自由文本药物名称,标准化为RxNorm RxCUI。它能解决药物名称、品牌名、通用名、成分、剂量和剂型等复杂关系,提供稳定、规范的编码,适用于临床互操作性、数据分析、去重和构建US Core Medication资源。
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不良事件报告结构化(E2B(R3))
reporting-adverse-events
maziyarpanahi/openmed
360
该技能用于将非结构化的不良事件描述文本,转化为符合ICH E2B(R3)标准的结构化数据。它能够系统性地提取和填充关键字段,包括可疑药物、反应(通过MedDRA编码)、严重性等级和结局等,是构建个体病例安全报告(ICSR)和进行药物警戒申报的专业工具。
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执行种子规范工作流
ouroboros-run
Q00/ouroboros
153
此工具是Ouroboros工作流引擎,用于执行复杂的种子(Seed)规范。它管理完整的生命周期,包括输入验证、流程编排、实时进度跟踪以及正式的收敛性评估。该技能适用于运行结构化、多步骤的计算工作流,并根据定义的标准评估结果。
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法国博士论文检索与图谱
recherche-theses-allison-fiorentino
lawve-ai/awesome-legal-skills
441
本技能专为学术研究人员和法律专业人士设计,用于检索、绘制和分析法国的博士学位论文。它支持多标准查询(包括学科、指导教授、评审委员会和院校),并能进行高级学术图谱绘制,追踪法律子学科和学术网络的时间演变,尤其侧重法国法律领域。
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