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Vast.ai 参考架构

vastai-reference-architecture
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
414
梳理Vast.ai GPU项目的参考架构，涵盖实例筛选、训练调度、Docker镜像构建、数据上下传和故障恢复，使团队能标准化机器学习流水线。
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窗口函数生成器助手

window-function-generator
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
409
自动触发的技能，指导分析师设计和校验窗口函数生成器工作流与 SQL 模式，兼顾可视化与业务洞察。
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可扩展基因调控网络推断

arboreto
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
240
使用 GRNBoost2/GENIE3 等可扩展算法，从 bulk 或单细胞表达数据中推断转录因子与靶基因关系，支撑大型转录组与 SCENIC 流程的调控网络分析。
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生物Python分子工具

biopython
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
280
Biopython 是一套完整的 Python 分子生物工具，支持序列操作、文件格式转换、NCBI 接入、BLAST 自动化、结构解析与系统发育分析，适合构建生物信息流程与批量任务。
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分子机器学习工具集

deepchem
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
103
DeepChem 是一个用于分子机器学习的 Python 库，提供数据加载、特征化、切分和建模功能，方便快速构建分子属性预测、MoleculeNet 基准测试以及药物发现和材料设计流程。
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ENA序列访问

ena-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
463
通过 REST 接口或 FTP 访问欧洲核苷酸档案库，快速获取 DNA/RNA 序列、原始读段、组装体、注释和分类信息，便于科研或生信流水线集成。
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Ensembl基因组数据库接口

ensembl-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
125
通过 Ensembl REST API 获取 250+ 物种的基因注释、序列、变异、同源基因及装配坐标映射，便于整合入基因组研究流程。
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FlowIO流式细胞文件处理

flowio
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
420
提供流式细胞FCS 2.0-3.1文件的读取、元数据与通道提取，以及 NumPy 数组导出和新文件生成，适合预处理流水线或简单的验证/格式转换需求。
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GWAS目录访问

gwas-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
424
通过 GWAS 目录网页或 REST 接口查询 SNP 与性状关联，获取研究、变异、性状信息及统计结果，支撑遗传流行病学与多基因风险模型研究。
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OFR对冲基金监控

hedgefundmonitor
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473
无需密钥即可调用OFR对冲基金开放接口，获取规模、杠杆、对手方、流动性与风险管理等系列时间数据，适合系统性风险监测与金融研究。
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LaminDB 生物数据湖仓

lamindb
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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LaminDB 通过湖仓架构、血缘追踪、标准化验证及本体注释，统一管理 scRNA-seq、空间、流式等生物数据，使其可查询、可追溯、可复现，并与 Nextflow、MLflow、W&B 等工作流和部署体系集成。
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Latch生物信息工作流

latchbio-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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LatchBio Integration 支持用 Python 装饰器构建无服务器生物信息工作流，结合 LatchFile/LatchDir 数据管理、资源调优与 Nextflow/Snakemake 集成，推进生产化流程。
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