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人类代谢物数据库查询

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 HMDB 检索 22 万余条人类代谢物信息，可按名称、ID、结构、疾病、标本筛选，获取化学、临床、通路和谱图数据并批量下载，支持代谢组学研究与生物标志物分析。

微生物组生物信息工具

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

scikit-bio 提供 Python 生物数据工具，支持 FASTA/Newick 等格式读写、序列操作、比对、系统发育树构建及多样性分析，适用于微生物组和群落生态研究。

系统发生树重建与分析工具包

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

这是一个完整的系统发生学分析流程，用于重建生物序列（基因、蛋白质）的进化关系。流程涵盖了从多序列比对（MAFFT）到最大似然树构建（IQ-TREE 2），再到可视化和分析（ETE3）的完整生命周期。适用于病毒动力学、微生物基因组学、分子时钟分析等前沿生物信息学研究。

物种特征综合识别技术

bio-taxonomic-combo

EverMind-AI/EverOS

本指南提供了一种高级的物种识别方法论。它教授如何利用多个生物学特征（如栖息地、形态、行为和地理范围）进行组合推理，以精准定位目标物种。核心技巧包括：当问题涉及国家人口统计学信息时，应首先利用人口增长或地方特有物种等信息锁定国家，从而极大地缩小物种搜索范围。

系统发生树重建与分析工具包

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

这是一个完整的系统发生学分析流程，用于重建生物序列（基因、蛋白质）的进化关系。流程涵盖了从多序列比对（MAFFT）到最大似然树构建（IQ-TREE 2），再到可视化和分析（ETE3）的完整生命周期。适用于病毒动力学、微生物基因组学、分子时钟分析等前沿生物信息学研究。

微生物组生物信息工具

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

scikit-bio 提供 Python 生物数据工具，支持 FASTA/Newick 等格式读写、序列操作、比对、系统发育树构建及多样性分析，适用于微生物组和群落生态研究。

多领域科学数据库查询

database-lookup

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

该技能能够连接并查询包含78个公共数据库的API接口，覆盖生物医学、物理科学、地球科学、经济学等多个领域。用户可以通过查询基因、化合物、专利、气候数据或金融指标等，系统选择合适的数据库，执行API调用，并返回完整的原始JSON数据，实现跨学科的深度信息检索。

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