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Deepgram 音频合规管理

deepgram-data-handling

jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills

指导 Deepgram 场景下的音频数据安全管理，包括加密上传、敏感信息脱敏、自动执行保留策略、GDPR 删除与数据导出，以及篡改防护审计日志，确保转录数据合规存储与访问。

可扩展基因调控网络推断

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

使用 GRNBoost2/GENIE3 等可扩展算法，从 bulk 或单细胞表达数据中推断转录因子与靶基因关系，支撑大型转录组与 SCENIC 流程的调控网络分析。

GEO基因表达提取器

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

连接NCBI GEO仓库，通过Entrez搜索GSE/GSM/GPL/Profiles，获取基因表达数据、实验设计和矩阵文件，配合GEOparse下载分析所需的转录组资料。

JASPAR转录因子结合位点工具

jaspar-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过调用 JASPAR API 和 Python 工具，获取 TF 结合模型、将 PFM 转为 PWM 并在 DNA 序列中扫描高置信度的结合位点，辅助调控变异注释、ChIP/ATAC 解读及转录因子网络构建。

单细胞RNA速度分析

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

scVelo 使用未剪接和剪接转录本计数估算细胞状态流向，重构发育轨迹、潜在时间并识别驱动基因，常用于单细胞RNA测序的 Scanpy 流程中。

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