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Pacsomatic肿瘤-正常样本分析工作流

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

该技能提供了用于匹配肿瘤-正常样本对分析的完整、可复现的工作流。它负责管理整个流程，包括输入验证（BAM文件）、生成pacsomatic兼容的样本表，创建可复现的启动工件（params YAML），并支持提交到各种调度器（如Slurm, LSF）。适用场景包括预运行验证（dry-run）、本地执行或提交作业，确保分析结果的稳定性和可追溯性。

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