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Datamol化学信息工具

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Datamol 提供 rdkit 的 Python 化封装，简化 SMILES/SELFIES/InChI 解析、结构标准化、分子描述符/指纹、聚类、3D 构象、并行批处理及云存储读写等药物发现流程，并保持与 rdkit.Chem.Mol 对象的兼容性。

开放靶点数据库平台

opentargets-database

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通过 Open Targets GraphQL API 查询靶点-疾病关联、可成药性、安全性、药物及多组学证据，帮助完成治疗靶点发现、优先级排序、安全评估和药物再利用等工作。

DepMap 依赖数据探索

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通过 DepMap 查询癌细胞系的 CRISPR Chronos 依赖评分、药物敏感性与基因效应，辅助靶点验证、生物标志物发现与合成致死研究，可用 API 或批量下载进行分析。

君主计划疾病知识库

monarch-database

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通过 Monarch Initiative API 查询跨物种的疾病-基因-表现型关联，用于罕见病基因发现、表现型映射与模型生物数据整合的研究。

RDKit化学信息学工具包

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RDKit是一个功能强大的化学信息学库，提供Python API用于分子结构操作和分析。它支持读取和写入多种分子格式（SMILES, SDF等），能够计算分子描述符、进行子结构搜索、处理立体化学和化学反应建模。本工具集是药物发现、计算化学和化学信息学研究的核心支持。

云原生分子建模工作流平台

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Rowan是一个基于云原生架构的综合性分子模拟和药物化学平台。它通过Python API提供统一接口，用于实现复杂的药物发现工作流，包括pKa预测、构象搜索、分子对接（单体和类似物系列）、蛋白质-配体共折叠和分子动力学模拟。用户无需维护本地高性能计算或GPU资源，即可进行大规模、可编程的批处理筛选。

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