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NGS 数据可视化利器

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

deepTools 提供命令行 Python 工具链，可将 BAM 转为标准化覆盖、完成 QC（指纹、相关、PCA）、比对样本，并绘制 ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq 的热图与轮廓等可视化，支持常见流程模板。

JASPAR转录因子结合位点工具

jaspar-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过调用 JASPAR API 和 Python 工具，获取 TF 结合模型、将 PFM 转为 PWM 并在 DNA 序列中扫描高置信度的结合位点，辅助调控变异注释、ChIP/ATAC 解读及转录因子网络构建。

NGS数据分析工具包

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

用于高通量测序数据分析的Python命令行工具包，支持ChIP-seq、RNA-seq和ATAC-seq等实验。提供质量控制、数据标准化、样本比较和高质量基因组可视化功能，包括bigWig转换和热图分析。

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