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天文学数据分析核心库
astropy
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
85
专业的Python天文学与天体物理核心库。提供处理天体坐标、物理单位、FITS文件、时间系统、宇宙学计算和表格数据等全套功能,是进行科学天文学数据分析的必备工具。
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科学论文结构化数据搜索
bgpt-paper-search
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
277
本工具适用于系统性文献综述和元分析。它能够搜索科学论文,并从全文中提取高度结构化的实验数据,远超传统摘要的限制。可获取包括方法、定量结果、样本量、质量得分和结论在内的25个以上字段,实现全面的证据综合。
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Biopython:生物计算工具包
biopython
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Biopython是一个全面的Python生物计算工具包,支持分子生物学和生物信息学领域的核心功能。它提供了序列处理、各种格式文件解析(如FASTA、GenBank、PDB)、系统发育树构建、序列比对(BLAST/多重比对)以及通过Bio.Entrez访问NCBI等大型数据库。非常适合构建生物信息学流程和进行基因组学研究。
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生物信息学:多数据库统一接口
bioservices
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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这是一个全面的Python库,提供了对40多个生物信息学数据库(如UniProt, KEGG, ChEMBL等)的编程访问接口。适用于复杂的生物学工作流,包括跨数据库ID映射、代谢通路分析、蛋白质序列检索和序列相似性搜索等,实现数据整合和自动化分析。
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大规模单细胞转录组数据查询
cellxgene-census
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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该技能提供对CZ CELLxGENE大型、版本化单细胞和空间转录组数据的程序化访问。用户无需下载整个数据集,即可查询数百万个细胞的基因表达数据,分析不同组织、疾病和物种间的差异。适用于大规模生物信息学分析、机器学习模型训练和跨数据集比较研究。
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临床决策支持研究评估工具
clinical-decision-support
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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本工具包专用于生成和验证临床决策支持(CDS)系统的研究级文档和评估工件。支持证据档案、队列分析、生存模型、生物标志物评估和治理流程的构建。请注意:本工具仅用于汇总研究和文档记录,绝对不能用于患者护理、诊断或实时临床操作。
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临床安全报告草稿生成
clinical-reports
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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本技能用于生成各类临床、安全和汇总研究报告(如CSR、汇总安全表)的草稿结构和确定性检查。它要求使用经过验证、去识别化或合成的源数据,并确保所有生成的主张都可追溯到来源事实清单。重要提示:本技能仅生成草稿和进行内部一致性检查,不能进行诊断、推荐治疗或提供医疗建议。所有输出均非临床用途,必须经过合格人员审核和签署。
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上下文模式工程洞察面板
ctx-insight
mksglu/context-mode
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本工具可打开上下文模式的洞察仪表盘,为AI辅助工程团队提供中央分析层。用户可以查看每位工程师的生产力速率、识别重复尝试浪费、检测项目阻碍点,并获取按角色划分的详细性能视图。它是团队性能监控和登录信息的单一信息源。
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分布式大数据计算框架
dask
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Dask是一个强大的Python库,用于处理超出内存限制或需要跨多机并行计算的大型数据集。它可以扩展传统的pandas和NumPy操作(DataFrame/Array),并处理非结构化数据(Bags)。适用于大规模数据抽取、转换、加载(ETL)、数据分析和分布式机器学习任务。
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Datamol:分子化学信息学工具库
datamol
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Datamol是一个基于RDKit的高级Python封装层,专为计算化学和药物发现设计。它简化了复杂的分子操作,提供智能默认值来处理SMILES标准化、描述符计算、指纹图生成、三维构象分析和分子聚类等任务。该库支持高效的并行计算和云存储I/O,非常适合处理大规模的化学数据集。
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自主深度研究与报告生成
deep-dive
rohitg00/awesome-claude-code-toolkit
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这是一个自主的深度研究系统,能够利用有向无环图(DAG)对复杂问题进行规划。它能并行执行多个子问题,进行知识空白分析和迭代,最终综合所有发现,生成结构化、全面的研究报告。适用于深度市场调研、学术文献回顾或需要多源数据支持的复杂问题分析。
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DeepChem:分子机器学习平台
deepchem
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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DeepChem是一个全面的Python库,专用于将机器学习应用于化学、材料科学和生物学领域。它支持分子属性预测(如ADMET、溶解度、毒性)、药物发现和材料设计。通过提供多种分子特征化方法和先进的图神经网络(GNN)以及预训练模型,该工具帮助用户处理SMILES等复杂化学数据集,进行深入的科学建模研究。
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