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代谢组学工作台API
metabolomics-workbench-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
465
通过 REST API 访问 NIH 代谢组学工作台,获取代谢物、RefMet 规范命名、质谱 m/z 检索与研究数据,支持生物标志物与代谢组学分析。
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分子特征化中心
molfeat
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
255
Molfeat 是一个 Python 库,集成 100+ 分子特征器、转换器与预训练模型,用于 QSAR、虚拟筛选、相似性搜索和深度学习等分子 ML 场景。
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NeuroKit2 生理信号处理
neurokit2
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
227
NeuroKit2 提供心电、脑电、皮电、呼吸、肌电、眼电等生理信号的处理与分析流水线,包括清理、心率变异、复杂度与多模态集成,便于心理生理学与临床研究应用。
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Neuropixels 神经记录分析
neuropixels-analysis
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
175
涵盖 SpikeGLX、Open Ephys、NWB 数据加载、预处理、运动校正、Kilosort4 排序、质量指标、Allen/IBL 筛选,以及 AI 辅助可视化的高密度 Neuropixels 记录分析工具。
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OpenAlex科研文献数据库
openalex-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
160
借助 OpenAlex 客户端查询 2.4 亿+ 学术成果,执行文献检索、引用追踪、开放获取发现与计量分析,覆盖论文、作者、机构等实体。
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开放靶点数据库平台
opentargets-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
293
通过 Open Targets GraphQL API 查询靶点-疾病关联、可成药性、安全性、药物及多组学证据,帮助完成治疗靶点发现、优先级排序、安全评估和药物再利用等工作。
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PathML 病理计算工具包
pathml
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
468
PathML 是用于计算病理的 Python 工具集,支持多种切片格式、H&E 预处理、图谱构建和 HoVer-Net/HACTNet 训练,方便多重免疫荧光及空间蛋白组分析与管理。
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PDB结构浏览器
pdb-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
130
通过 RCSB PDB 搜索蛋白或核酸结构、下载 PDB/mmCIF/Binary 坐标文件、获取实验元数据并批量处理,为药物发现、蛋白工程和结构生物学提供数据支撑。
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科学同行评审检查表
peer-review
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
219
为审稿人提供一套结构化流程,涵盖方法、统计、报告规范与建设性建议,便于跨学科开展严谨的科学稿件与基金评审。
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Plotly 交互式图表
plotly
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
479
Plotly 是 Python 交互式图形库,适合数据探索、仪表盘与汇报,支持提示、缩放、动画和多种导出格式。
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PubMed 数据库访问
pubmed-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
219
通过 PubMed 的 REST/API 接口构建布尔、MeSH 查询,按类型和时间等属性过滤文献,并借助 NCBI E-utilities 自动抓取摘要、引用和批量处理。
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PyDESeq2 差异表达分析
pydeseq2
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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PyDESeq2 将 DESeq2 差异表达流程搬到 Python 中,可加载批量 RNA-seq 计数、设定设计公式、拟合模型、执行 Wald 检验并做 FDR 校正,支持 apeGLM 收缩及与 pandas/AnnData 流程衔接,便于导出基因级统计结果。
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