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安全洗牌JSON数据结构
shuffle-json-data
github/awesome-copilot
111
本工具具备数据工程师的角色,用于安全地随机重排JSON数组中的重复对象。在执行洗牌操作前,它会严格执行数据结构校验,确保所有对象具有一致的属性集,并且结构上不允许嵌套对象。这保证了在随机化过程中,数据的完整性和JSON的语法有效性不会受到任何破坏。
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Arize实验评估与管理
arize-experiment
github/awesome-copilot
90
本技能提供了一套完整的Arize实验管理工具,用于AI模型性能的评估、比较和分析。用户可以使用它来创建、列出、获取和导出实验结果,支持进行模型基准测试和A/B测试,确保模型在特定数据集上的准确性。
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GA4 数据自动化工具
google-analytics-automation
sickn33/antigravity-awesome-skills
234
通过 Composio 的 Rube MCP 自动化 GA4 报表与属性管理,涵盖账号/属性发现、标准/批次/透视/漏斗报表以及关键事件管理,便于分析师免于重复 UI 操作。
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单细胞注释数据分析框架
anndata
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
472
AnnData是一个用于处理单细胞和高维注释矩阵的核心Python框架。它提供了一个标准化的数据结构来存储实验测量值(X)及其丰富的元数据(obs, var)。用户可以使用此工具读取和写入多种格式(如h5ad, zarr),并进行数据子集提取、合并和复杂的分析操作,是生物信息学工作流程的关键工具。
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生物信息学:多数据库统一接口
bioservices
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
285
这是一个全面的Python库,提供了对40多个生物信息学数据库(如UniProt, KEGG, ChEMBL等)的编程访问接口。适用于复杂的生物学工作流,包括跨数据库ID映射、代谢通路分析、蛋白质序列检索和序列相似性搜索等,实现数据整合和自动化分析。
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分布式大数据计算框架
dask
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
206
Dask是一个强大的Python库,用于处理超出内存限制或需要跨多机并行计算的大型数据集。它可以扩展传统的pandas和NumPy操作(DataFrame/Array),并处理非结构化数据(Bags)。适用于大规模数据抽取、转换、加载(ETL)、数据分析和分布式机器学习任务。
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深层工具:NGS基因组分析平台
deeptools
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
395
deepTools是一个用于处理和分析高通量测序数据的综合命令行工具包。它涵盖了从BAM到bigWig的转换、数据质量控制(QC)、归一化、以及为ChIP-seq、RNA-seq和ATAC-seq等数据生成专业级热图和谱图。是进行可重复基因组学研究流程的必备工具。
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DNAnexus基因组工作流管理
dnanexus-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
184
该技能提供了一套全面的解决方案,用于构建、运行和自动化复杂的、可复现的基因组学工作流程。它深度集成了`dx`命令行工具、`dxpy` Python SDK以及Nextflow等主流工作流语言。适用于大型生物计算任务的数据传输、作业监控、项目自动化以及确保安全高效的流程执行。
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流式细胞术FCS文件读写工具
flowio
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
207
FlowIO是一款专用于读写流式细胞术标准文件(FCS 2.0, 3.0, 3.1)的底层工具。它能够帮助用户提取事件数据为NumPy数组,详细检查元数据(包括HEADER、TEXT等),并处理多数据集文件。该工具主要用于数据准备、格式转换和底层元数据管理,是生物信息学流程中的基础组件,但不执行复杂的分析任务如门控或补偿校正。
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基因组区间机器学习工作流
geniml
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
412
Geniml是一个用于基因组区间数据机器学习和统计工作流的框架。它将坐标、组装序列和模型工件视为明确的“合约”,用于验证数据结构(如BED文件),并规划复杂的本地化运行(如Region2Vec或scEmbed)。该工具注重结果的可复现性、符合生物数据标准,并强调本地处理,避免不必要的网络调用。
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综合地理空间分析工具
geomaster
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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这是一个全面的地理空间科学技能包,涵盖了遥感、GIS、空间统计和地球观测机器学习。它支持处理栅格、矢量、点云等多种数据类型(如Sentinel、Landsat),并集成了现代云原生工作流(STAC、COG)。适用于环境监测、城市规划和复杂的空间分析任务。
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GeoPandas地理空间矢量数据处理
geopandas
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
380
本指南是使用GeoPandas进行高级地理空间矢量数据处理的专业手册。它侧重于平面矢量数据的工作流,强调数据溯源、坐标参考系统(CRS)管理和复杂空间操作。详细阐述了处理敏感地理信息时必须遵循的安全和正确性规范,确保开发流程的科学性和可复现性。
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