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Data Commons 客户端

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K-Dense-AI/claude-scientific-skills

提供 Data Commons 的 Python 客户端，可解析实体、查询人口、经济、健康等公共统计数据，并结合 Pandas 处理观测记录，适合探索知识图谱中的统计关系。

系统发育树工具包

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ETE 工具包提供系统发育树操作、进化事件检测、NCBI 分类信息集成以及高质量图形化展示，助力系统发育组学研究与聚类分析。

病理切片分析工具

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

PathML 是面向计算型病理的 Python 工具，支持整张切片读取、染色预处理、空间图谱构建以及多参数免疫荧光数据的机器学习分析。

STRING蛋白互作查询

string-database

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过调用 STRING REST API 查询蛋白互作网络、映射标识符、生成带证据着色的网络图，并对蛋白列表执行 GO/KEGG/Pfam 富集，支持跨物种分析与网络扩展。

癌症依赖地图分析

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

通过 DepMap API 或下载数据查询癌细胞基因依赖、药物敏感性与基因效应，发现肿瘤特异脆弱点、合成致死关系并验证靶点。

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