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UniProt蛋白质数据库查询与分析
uniprot-database
sickn33/antigravity-awesome-skills
185
用于访问和查询UniProt蛋白质数据库,这是蛋白质序列和功能信息领域的权威资源。支持通过名称、基因或访问号搜索蛋白质,检索FASTA格式序列,实现跨数据库ID映射(如Ensembl, RefSeq),并分析GO术语等功能注释,是生物信息学数据分析的核心工具。
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注释配置与审核队列管理
arize-annotation
github/awesome-copilot
133
本技能用于在Arize平台上创建和管理注释配置(如分类、连续、自由文本标签)和人工审核队列。它支持定义不同类型的标签结构,并允许用户通过Python SDK将人类反馈标签程序化地应用于项目跨度、数据集等,从而实现结构化的人工标注和模型监控。
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生物学化学/数值精准匹配
bio-chemical-numeric
EverMind-AI/EverOS
429
当生物学问题涉及特定的化学化合物名称、精确的浓度值(如“0.330 mg/100g”)或分类学同义词计数时,使用此技巧。通过使用引号进行精确匹配,并结合多个具体的化合物名或数值,可以极大地提高搜索的唯一性和准确性,尤其适用于生物化学和植物学研究。
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AnnData:单细胞注释数据结构
anndata
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
176
AnnData是一个专业的Python库,用于处理和分析注释化的矩阵数据,尤其适用于单细胞基因组学和生物信息学领域。它能高效存储实验测量值(X)和多维度的元数据(obs, var等)。本技能支持读取、写入、子集和拼接大型复杂数据集(如.h5ad、.zarr),是进行scRNA-seq分析和集成scverse生态系统的关键工具。
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基因组区间机器学习
geniml
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
237
Geniml是一个用于对基因组区间数据(BED文件)进行机器学习建模的Python工具包。它提供了多种无监督方法(如Region2Vec和BEDspace),用于学习基因组区域、单细胞(scATAC-seq)和元数据关联的鲁棒嵌入。适用于基因组学研究中的降维、聚类、细胞类型注释和跨模态查询等任务。
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OMERO显微镜数据管理与分析
omero-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
159
该技能提供OMERO平台的综合Python API接口,用于管理和分析大规模显微镜数据集。用户可以通过编程方式访问图像、检索结构化数据、分析原始像素数据、管理感兴趣区域(ROIs)和复杂注释,执行批处理工作流,特别适用于高通量筛选和生物学研究。
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质谱分析与数据处理平台
pyopenms
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
391
这是一个基于Python的质谱分析计算平台,专为蛋白质组学和代谢组学工作流设计。它支持从原始MS数据到鉴定、定量(包括无标签和等位素定量)的完整分析流程,能够处理复杂的LC-MS/MS数据,是生物信息学研究的强大工具。
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单细胞RNA测序分析
scanpy
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
123
这是一个功能全面的Python工具包,用于执行从原始数据到最终细胞类型注释的单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析。它支持质量控制(QC)、数据标准化、降维(PCA/UMAP/t-SNE)、细胞聚类和差异基因表达分析等全流程。用户可以使用内置的脚本处理多种格式的数据,生成高质量的生物学图谱和注释报告。
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标注数据管理工具
annotation-data
SharpAI/DeepCamera
446
本工具用于管理和处理标注数据集,提供完整的CRUD(创建、读取、更新、删除)功能,支持标签管理和数据导出。核心功能包括支持COCO格式导出和Kaggle平台上传,旨在简化AI模型开发的数据处理流程,提升效率。
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ClickHouse并发与资源限流配置
clickhouse-rate-limits
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
306
本技能指导如何配置和管理ClickHouse的服务器端资源限制、用户配额和连接管理。当遇到“并发查询过多”或其他资源瓶颈时使用。内容涵盖SQL配额设置、客户端连接池和应用层级的并发控制及重试机制,确保数据操作的稳定性和可靠性。
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Clari预测数据导出流程
clari-core-workflow-a
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
95
这是一个自动化工作流,用于将Clari CRM中的关键销售数据(包括预测、配额、调整和CRM总额)导出到指定的数据仓库。它支持连接Snowflake、BigQuery等多种数据源,确保实时的收入情报数据可用于深入分析和业务报告。
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Clari预测和管道快照导出
clari-hello-world
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
58
本技能详细指导用户如何通过API连接Clari,实现核心商业数据的导出。流程包括列出可用预报、发起预测和配额快照导出,到监控任务状态并下载最终数据。适用于API连接测试和将Clari的营收智能数据集成到外部数据流程。
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