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Arboreto基因调控网络

K-Dense-AI/claude-scientific-skills

Arboreto利用GRNBoost2/GENIE3从批量或单细胞RNA-seq表达数据中推理转录因子与靶基因调控关系，支持TF筛选与Dask分布式运行，输出排序链接供后续分析。

基因调控网络推断

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

Arboreto是一个强大的Python库，用于从各种基因表达数据集（如单细胞或批量RNA-seq）推断基因调控网络（GRN）。它利用GRNBoost2和GENIE3等算法，识别转录因子与目标基因之间的关键调控关系。支持Dask分布式计算，适用于大规模高通量转录组学分析。

UMAP非线性降维与可视化

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

UMAP是一种强大的非线性降维技术，用于将高维数据映射到低维空间（如2D/3D）。本工具支持用于数据可视化、聚类预处理和特征工程，能够保留数据的高维结构，并支持监督学习和多种距离度量指标。

ClickHouse数据导入与管道构建

clickhouse-webhooks-events

jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills

本教程提供了一套构建ClickHouse数据摄取管道的完整解决方案。它涵盖了从多种来源（如HTTP Webhooks、Kafka、S3等）导入数据的最佳实践。内容详细展示了如何实现数据批处理、去重（使用ReplacingMergeTree）以及系统监控，确保数据流的稳定性和可扩展性，适用于构建大型实时数据分析系统。

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