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GeoPandas空间分析工具

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GeoPandas 在 pandas 基础上提供地理矢量数据处理能力，可读写多种格式、投影、空间连接与叠加、缓冲与可视化，适合街区分析、地图制作与 PostGIS 集成工作。

计算资源监控助手

get-available-resources

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在科学计算开始前检测 CPU、GPU、内存和磁盘资源，生成 JSON 报告并给出并行、内存和 GPU 策略建议，帮助选择最优的计算方式。

OFR对冲基金监控

hedgefundmonitor

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无需密钥即可调用OFR对冲基金开放接口，获取规模、杠杆、对手方、流动性与风险管理等系列时间数据，适合系统性风险监测与金融研究。

科学假设生成

hypothesis-generation

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在观察或文献基础上构建可检验的科学假设、设计实验、对比解释与制定预测，并要求配合 AI 生成的科学图示完成分析报告。

Latch生物信息工作流

latchbio-integration

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LatchBio Integration 支持用 Python 装饰器构建无服务器生物信息工作流，结合 LatchFile/LatchDir 数据管理、资源调优与 Nextflow/Snakemake 集成，推进生产化流程。

系统性文献综述

literature-review

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系统执行文献回顾，跨PubMed、arXiv、Semantic Scholar等数据库检索、汇总主题发现、核实引文并生成带AI图示的Markdown/PDF格式报告，适用于论文、综述或研究背景整理。

分子特征化中心

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Molfeat 提供 100 多种分子特征器与预训练嵌入，可将 SMILES 或 RDKit 分子转换为适合 QSAR、虚拟筛选、相似性搜索与深度学习的数值特征，支持并行、缓存与 scikit-learn 集成。

Plotly 交互式图表

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Plotly 是 Python 交互式图形库，适合数据探索、仪表盘与汇报，支持提示、缩放、动画和多种导出格式。

PyDESeq2 差异表达分析

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PyDESeq2 是在 Python 中复现 DESeq2 的差异表达分析工具，可载入 bulk RNA-seq 计数、过滤低表达基因、指定单/多因素设计、执行 Wald 检验并进行 LFC 收缩，方便结合 pandas/AnnData 管道输出结果和可视化。

Scanpy 单细胞分析流程

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Scanpy 以 AnnData 为基础，构建可扩展的单细胞 RNA-seq 分析流程，涵盖质控、归一化、降维、聚类、标记基因发现、细胞注释、轨迹推断与出版级可视化，适用于探索型 scRNA-seq 研究。

单细胞生成建模工具

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提供基于 PyTorch 的概率生成模型，面向单细胞 RNA、ATAC、空间与多模态数据，自动校正批次效应、支持不确定性差异分析，便于与 scanpy 流程对接。

TileDB VCF 变体存储

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TileDB-VCF 使用 TileDB 稀疏数组高效管理 VCF/BCF 变异数据，支持增量样本、并行区域查询、云本地存储与导出，适合群体基因组分析与变异数据库构建。

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