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学术研究流程编排器

academic-pipeline

Imbad0202/academic-research-skills

这是一个全面的学术研究流程编排工具。它能够管理从初级研究到最终发表的完整科研周期，流程包含10个强制阶段，强制执行数据完整性验证和两阶段同行评审。它负责协调多个专业技能，确保整个学术写作工作流的质量和可复现性。

跨领域科研文献检索

sickn33/antigravity-awesome-skills

用于对学术研究和政策文件进行确定性、可复现的证据检索。支持搜索arXiv预印本、PubMed/PMC生物医学文献和美国政策语料库。提供语料库新鲜度检查、元数据查找和全文Markdown提取功能，确保研究结果的可靠性。

大规模RNA-seq差异表达分析

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

本技能是一个端到端的管线编排器，用于完成大规模RNA-seq的差异表达分析。它指导用户从原始FASTQ数据开始，依次经过质量控制、数据修剪、比对定量、生成基因计数矩阵，最终进行差异表达分析和通路富集。旨在确保整个生物信息学流程的完整性、可复现性和统计学可靠性。

Nextflow工作流管道开发与运行

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

Nextflow是一个强大的工作流语言和运行时，用于构建可复现、跨平台、可扩展的数据管道。它在生物信息学领域尤为重要，支持数据流编程，并能将工作流部署到高性能计算集群（HPC）和各类云平台。本书技能覆盖了从运行既有管道到开发自定义模块化工作流的全过程，保障了计算流程的可靠性和可重复性。

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