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RDKit化学信息学分子工具包

rdkit
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RDKit是一个功能强大的开源化学信息学库，提供全面的Python API，用于分子结构分析和操作。它支持读取和写入多种分子格式（如SMILES、SDF），计算理化描述符、指纹图谱，并执行子结构搜索、立体化学分析等。该工具集是药物发现、计算化学和材料科学研究的关键资源。
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单细胞RNA测序分析

scanpy
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这是一个功能全面的Python工具包，用于执行从原始数据到最终细胞类型注释的单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析。它支持质量控制（QC）、数据标准化、降维（PCA/UMAP/t-SNE）、细胞聚类和差异基因表达分析等全流程。用户可以使用内置的脚本处理多种格式的数据，生成高质量的生物学图谱和注释报告。
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生物信息学数据分析工具

scikit-bio
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这是一个全面的Python生物信息学工具包，用于处理和分析生物学数据。核心功能包括DNA/RNA/蛋白质序列操作、配对和多重序列比对、构建和分析系统发育树，以及计算Alpha/Beta多样性等生态学指标。适用于微生物组学分析、进化学研究和各种生物数据处理，支持FASTA、Newick等标准格式。
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单细胞组学生成模型工具箱

scvi-tools
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这是一个基于深度生成模型和变分推断的综合性Python框架，用于先进的单细胞组学分析。它支持单细胞RNA-seq、ATAC-seq、CITE-seq以及空间转录组等多种多模态数据的深度整合与分析。核心功能包括概率批次校正、细胞类型注释和多组学整合。
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预训练模型与AI开发工具

transformers
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这是一个全面的深度学习工具库，提供了数千个预训练模型，覆盖自然语言处理、计算机视觉、音频和多模态等多领域任务。它允许开发者使用Pipeline API进行快速推理，或者使用Trainer API对模型进行定制化微调。适用于构建复杂的、前沿的AI应用和原型系统。
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UMAP非线性降维与可视化

umap-learn
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UMAP是一种强大的非线性降维技术，用于将高维数据映射到低维空间（如2D/3D）。本工具支持用于数据可视化、聚类预处理和特征工程，能够保留数据的高维结构，并支持监督学习和多种距离度量指标。
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美国财政部财金数据API接入

usfiscaldata
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这是一个用于连接美国财政部财金数据REST API的工具。它允许用户免费查询美国政府的多个联邦金融数据集，涵盖了包括国债（总债务）、利率、外汇汇率、政府收入和支出统计等。适用于进行宏观经济分析、金融建模和数据研究。
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自动化规格文档生成器

kiro-spec-quick
gotalab/cc-sdd
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该工具提供一个完整的、多阶段的规格文档生成流程，包括初始化、需求分析、设计方案和任务分解。它支持交互式和自动模式运行，能确保生成的内容逻辑连贯。最后还会运行一次最终的完整性检查，确保生成的规格是一份可直接投入开发使用的蓝图。
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Alchemy调试报告生成器

alchemy-debug-bundle
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本工具用于生成全面的Alchemy SDK调试报告。它能自动收集关键的诊断证据，包括核心API、增强API和NFT API的连接性测试，同时检查多个主流区块链网络（如以太坊、Polygon）的状态，以及SDK版本和环境信息。适用于遇到复杂的区块链查询失败或需要提交专业支持工单时进行故障排查。
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Apify核心存储与工作流管理

apify-core-workflow-b
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本工具提供对Apify核心存储（数据集、键值存储和请求队列）的全面编程管理能力。它可以执行CRUD操作，实现数据持久化和复杂、多阶段的数据管道编排（例如：爬取→转换→导出）。适用于构建健壮的端到端网络爬取和数据处理自动化工作流。
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多环境备忘录配置管理

apple-notes-multi-env-setup
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本工具用于管理Apple Notes中的多环境数据隔离。它允许用户利用不同的账户（如iCloud、本地设备）来区分生产、预发布和开发环境的笔记。这确保了在复杂的开发和测试流程中，测试数据不会意外污染到实际的生产数据，极大地提高了开发和部署的准确性与可控性。
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文本压缩与极简写作模式

caveman-help
JuliusBrussee/caveman
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这是一个风格压缩工具的参考指南，提供多种压缩模式（如Lite, Full, Ultra）和专业技能（如Commit, Review）。它能将冗长、口语化的文本压缩成高度精炼、简洁专业的风格。非常适合开发者撰写简洁的开发文档、提交信息，或进行文本的极简化摘要。
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