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PyDESeq2 差异表达分析
pydeseq2
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
431
使用 PyDESeq2 对 bulk RNA-seq 进行差异基因表达分析,支持公式化设计、Wald 检验、FDR 校正、LFC 收缩和结果可视化。
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单细胞基因组深度学习工具
scvi-tools
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
426
scvi-tools 是一个全面的 Python 框架,用于单细胞基因组学中的概率深度学习模型。基于 PyTorch 和 PyTorch Lightning 构建,支持批次校正、迁移学习、带不确定性的差异表达分析和多模态数据整合。适用于单细胞 RNA-seq、ATAC-seq、CITE-seq、空间转录组学及甲基化、流式细胞术等专用模态的高级建模分析。
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竞争分析与市场定位
competitor-analyst
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
150
这是一个专业的竞争情报助手,专为产品经理设计。它不只停留在功能对比,而是深入分析整个市场格局,挖掘用户真正的需求(Jobs-to-be-done),发现竞争对手的定位漏洞,并输出可执行的战略建议,帮助你制定差异化、高价值的产品路线图。
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GitHub库版本发布自动化
github-release
github/awesome-copilot
291
本技能旨在自动化GitHub库的完整发布流程。它能够处理语义化版本号(SemVer)的升级,通过代码差异分析(diff)自动生成发布日志(Changelog),并创建发布PR。该流程仅依赖于GitHub CLI和Git,实现从代码分析到版本发布的全周期自动化。
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批量 RNA 测序分析流程
bulk-rnaseq
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
211
端到端批量 RNA 测序分析编排器,引导用户从原始 FASTQ 读取到质量控制、比对、定量及差异表达分析。支持 nf-core/rnaseq 或 STAR/Salmon 等独立工具,确保基因水平计数和通路富集分析的可重复性与统计可靠性。
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通路富集分析
pathway-enrichment
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
296
对基因列表或排名数据进行通路和基因集富集分析,使用 gseapy、Enrichr 等工具。支持 ORA、GSEA、ssGSEA 及功能分析,涵盖 GO、KEGG、Reactome 等数据库。适用于解读差异表达结果、CRISPR 筛选结果及聚类标记,识别过度代表的生物通路。
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复杂迁移方案规划助手
meta-migration-assistant
opensquilla/opensquilla
343
这是一个元级助手,用于生成全面、分步的软件迁移计划。它能智能协调多步骤流程,包括采集迁移需求、分类源/目标技术栈(如CJS到ESM、Py2到Py3)、查找权威指南和分析代码差异。特别适用于大型、复杂的软件升级和重构项目。
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自动化PR代码审查与CI修复
pr-review-ci-fix
ComposioHQ/awesome-codex-skills
89
利用Composio CLI自动化GitHub和GitLab的PR审查和CI修复流程。它能自动获取代码差异、分析失败的CI日志,并在PR中发布结构化的内联评论,并循环执行修复、推送和重新运行检查,直到代码通过所有测试,极大地提高了代码质量和开发效率。
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AI协作过程证据分析器
collab-proof
alirezarezvani/claude-skills
416
本工具用于深入分析开发者与AI模型(如Claude)的协作过程,自动捕捉并结构化那些未被开发者主动记录的关键证据。它通过分析版本控制差异(git diff)和对话上下文,评估技术复杂度、识别决策分歧点,并量化AI的贡献,为项目回顾和知识沉淀提供系统化的依据。
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预算差异分析报告
budget-variance-analysis
mohitagw15856/pm-claude-skills
225
本技能用于生成完整的预算差异分析报告。它不仅提供实际与预算的对比表,还能深入分析超出阈值的各项差异的根本原因(区分永久性与时间性),并为管理层提供行动建议和修正的全年预测,适用于财务回顾和董事会汇报。
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GitHub Actions工作流调试专家
github-actions-debugger
sickn33/antigravity-awesome-skills
116
本技能是专业的CI/CD诊断工具,专注于分析失败的GitHub Actions工作流日志。它能够识别出失败的根本原因,包括缺失的密钥、环境配置不匹配或过时的语法。最终输出将提供精确的YAML或代码差异(diff),指导用户修复和优化整个流水线。
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代码执行流程跟踪解释
logic-explain
sickn33/antigravity-awesome-skills
197
这是一个用于生成代码指定输入场景的详细、分步、跨过程执行跟踪的技能。它能够解析命名歧义、追踪类型转换,并高亮显示非显而易见的行为。当用户对代码的实际运行过程感到困惑时,可以使用本工具进行深入分析,从而清晰地分辨出实际执行路径和用户假设之间的差异。
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