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Benchling生命科学数据集成

benchling-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
434
本技能提供通过Python SDK和REST API访问Benchling云平台的功能。它用于自动化管理和查询生命科学的关键数据，包括序列注册实体（DNA、RNA、蛋白质）、物理库存、电子实验记录本（ELN）和工作流。适用于数据同步、数据仓库分析以及构建复杂的LIMS系统集成。
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生物信息学计算工具箱

biopython
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
386
Biopython是一个全面的Python库，专为分子生物学和生物信息学设计。它提供了强大的工具，用于序列操纵（DNA、RNA、蛋白质），解析标准生物文件格式（FASTA, GenBank, PDB），并通过Entrez访问NCBI等外部数据库，并执行序列比对、系统发育树构建和结构生物学等复杂分析。非常适合构建自动化、稳健的生物信息学流程。
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AI智能体自进化引擎

capability-evolver
EvoMap/evolver
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Evolver是一款为AI智能体设计的自进化引擎。它能深入分析运行时的历史记录，识别性能缺陷和效率低点，并自主编写和应用改进方案。其架构通过本地代理信箱（Proxy Mailbox）与EvoMap Hub进行安全通信，适用于构建高度自适应、持续迭代的智能系统。
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科学假设生成

hypothesis-generation
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
213
本技能指导用户遵循科学方法论，从观察或初步数据出发，系统性地构建可测试的科学假设。它涵盖了文献检索、证据综合、提出多个竞争假设、评估假设质量（如可证伪性），并设计详细的实验方案。报告中强制要求使用科学示意图进行可视化。
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分子动力学模拟流程

molecular-dynamics
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
120
本技能提供分子动力学模拟的完整工作流程，涵盖了系统构建、势场定义、能量最小化和平衡化过程。使用OpenMM和MDAnalysis等专业工具，适用于蛋白质结构稳定性分析、药物结合建模及生物物理学研究。
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系统发生树构建与分析工具包

phylogenetics
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
496
本工具包提供完整的系统发生学分析流程，涵盖序列比对、数据精修和树状图构建。集成了MAFFT进行多序列比对，IQ-TREE 2和FastTree进行最大似然树推断。适用于分子基因组学、病毒进化追踪、蛋白质家族分析和分子时钟研究等领域，实现自动化生物信息学分析。
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生物数据分析工具包

scikit-bio
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
282
scikit-bio是一个全面的Python库，专为生物信息学和生物数据分析设计。它提供强大的功能，用于处理DNA、RNA和蛋白质序列，执行复杂的序列比对，构建和分析系统发育树，并进行高级的生态学统计。核心能力包括计算多样性度量、进行降维分析（PCoA）以及处理多种生物学文件格式（如FASTA，Newick）。适用于微生物学、基因组学和生态学研究领域。
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内存外海量数据分析

vaex
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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Vaex是一个高性能的Python库，专为内存外（out-of-core）计算设计，能够处理和可视化超出系统内存限制的超大型表格数据集。它支持高效进行大规模数据筛选、统计聚合、可视化和构建机器学习模型，特别适用于单机环境下的TB级数据分析。
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Adobe API集成架构设计

adobe-reference-architecture
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本架构提供了一个生产级的、模块化的设计蓝图，用于集成Adobe生态系统中的多个API，如Firefly、PDF服务和I/O事件。它强制遵循分层架构（API -> 服务 -> 客户端 -> 基础设施），确保了代码的关注点分离、统一的认证管理、完善的错误边界处理和可扩展的工作流编排，适用于构建复杂的企业级应用。
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设计到代码系统架构

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jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
89
本文档提供了一套完整的“设计到代码”自动化参考架构。它详细规划了从Figma设计源到最终React/Vue代码的整个转换流程，涵盖了Figma API连接、代码生成、组件扫描和后处理（如设计令牌映射）等关键步骤。适用于构建企业级设计系统，实现高效、可维护的自动化设计资产交付。
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Figma设计到代码自动生成

anima-webhooks-events
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本技能展示了如何使用Figma Webhooks搭建一个事件驱动的“设计到代码”工作流。当Figma设计文件发生版本更新时，系统能够自动捕获事件，并触发Anima服务，实时、自动化地重新生成高质量的组件代码（如React/TypeScript），适用于构建持续集成和设计流程。
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苹果笔记自动化参考架构

apple-notes-reference-architecture
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
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本指南提供了在macOS上自动化管理苹果笔记的参考架构。由于缺乏REST API，该系统采用分层设计，结合Node.js、通过osascript调用JXA脚本、本地SQLite缓存和FSEvents轮询等技术，为构建本地化的笔记管理和数据导出提供了完整的技术蓝图。
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