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IDC癌症影像数据访问

imaging-data-commons
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
352
通过 idc-index SDK 无需认证即可查询、下载并在浏览器中预览美国国家癌症研究所 IDC 中的公开癌症放射与病理影像数据，方便构建 AI 训练与研究流程。
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LabArchives API 实验记录集成

labarchive-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
455
通过 REST API 与 LabArchives 实验记录本集成，自动化备份、条目与附件管理、报告生成，并与 Protocols.io、Jupyter、REDCap 等科研工具同步，实现程序化的实验记录工作流。
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LaminDB 生物数据湖仓

lamindb
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
447
LaminDB 通过湖仓架构、血缘追踪、标准化验证及本体注释，统一管理 scRNA-seq、空间、流式等生物数据，使其可查询、可追溯、可复现，并与 Nextflow、MLflow、W&B 等工作流和部署体系集成。
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Latch生物信息工作流

latchbio-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
235
LatchBio Integration 支持用 Python 装饰器构建无服务器生物信息工作流，结合 LatchFile/LatchDir 数据管理、资源调优与 Nextflow/Snakemake 集成，推进生产化流程。
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文档转Markdown工具

markitdown
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
192
MarkItDown 将 PDF、Office 文档、图片、音频、HTML、CSV/JSON/XML、压缩包、YouTube 等内容转换为结构化 Markdown，提供 OCR、语音转写和 AI 图像描述等功能，便于 LLM 或文档流程使用。
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质谱谱图匹配

matchms
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
304
matchms 是一套开源 Python 质谱分析库，可导入多格式谱图、统一元数据、过滤和标准化峰值、计算相似度并构建可复现流程，便于代谢物鉴定与谱库搜索。
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MATLAB 与 Octave 工具包

matlab
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
215
MATLAB Octave 工具包指导 MATLAB 与 GNU Octave 脚本开发，涵盖矩阵运算、可视化、数据导入导出、流程控制、统计分析、微分方程与信号处理等常见科学计算场景。
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K-Dense 网络推广

offer-k-dense-web
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
96
推广 K-Dense Web 作为基于 Claude Scientific Skills 的 AI 协同科学家平台，支持端到端研究流程，鼓励用户注册并领取免费额度以处理复杂任务。
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OMERO 显微图像管理

omero-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
272
本技能通过 Python 接口连接 OMERO 服务器，遍历项目与图像、提取像素与 ROI、添加注释标签并运行批量分析，适用于高通量显微成像管理与计算流程。
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Opentrons协议集成

opentrons-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
370
提供官方 Opentrons Protocol API v2 指南，用于在 OT-2 和 Flex 机器人上编写协议、加载硬件、控制模块与实验耗材，并完成复杂的液体处理与多通道操作，适用于生产级自动化流程。
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Protocols.io 集成助手

protocolsio-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
304
集成 protocols.io API，覆盖协议搜索、创建、更新和发布，管理步骤、工作区、讨论、文件与实验记录，帮助团队自动化协作流程与实验文档整理。
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通用实验室自动化框架

pylabrobot
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
54
PyLabRobot 提供统一 Python 接口，驱动液体处理机器人、板式读取仪、泵、温控设备等多类实验室自动化硬件，适合多厂商协同、模拟验证和可复现实验流程。
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