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高性能基因组区间分析工具包

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Gtars是一个高性能的基因组信息学工具包，使用Rust语言编写并提供Python接口。它专注于基因组区间数据的处理与分析，核心功能包括：基因组区域重叠检测、覆盖度图谱生成、以及用于机器学习模型的基因组序列Tokenization。适用于计算基因组学、生物信息学和单细胞分析等领域。

生物信息学工作流平台

latchbio-integration

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这是一个基于Python的生物信息学工作流开发和部署平台。它允许用户使用装饰器定义服务器无状态管线，支持Python、Nextflow和Snakemake等多种格式。核心功能包括云数据管理、资源配置（GPU/CPU）以及运行预设的复杂分析，适用于基因组学和蛋白质结构预测等大规模计算任务。

系统发生树重建与分析工具包

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这是一个完整的系统发生学分析流程，用于重建生物序列（基因、蛋白质）的进化关系。流程涵盖了从多序列比对（MAFFT）到最大似然树构建（IQ-TREE 2），再到可视化和分析（ETE3）的完整生命周期。适用于病毒动力学、微生物基因组学、分子时钟分析等前沿生物信息学研究。

微生物组生物信息工具

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scikit-bio 提供 Python 生物数据工具，支持 FASTA/Newick 等格式读写、序列操作、比对、系统发育树构建及多样性分析，适用于微生物组和群落生态研究。

多领域科学数据库查询

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该技能能够连接并查询包含78个公共数据库的API接口，覆盖生物医学、物理科学、地球科学、经济学等多个领域。用户可以通过查询基因、化合物、专利、气候数据或金融指标等，系统选择合适的数据库，执行API调用，并返回完整的原始JSON数据，实现跨学科的深度信息检索。

Linktree生产环境检查清单

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jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills

本清单旨在为Linktree API集成提供全面的生产环境加固指南。内容涵盖安全密钥管理、限流机制、强大的错误恢复逻辑（如熔断器和指数退避），以及关键的监控和安全实践，例如Webhook签名验证。使用本清单确保在流量高峰期，链接生物信息页面的数据准确性、系统持续可用性和性能表现。

Pacsomatic流程管理工具

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该技能是用于执行匹配的肿瘤-正常样本基因组分析的完整工作流管理工具。它负责处理输入验证、生成符合pacsomatic标准的样本表和可复现的启动工件（如params YAML、启动脚本），并支持在本地或集群调度器（Slurm, LSF等）上执行任务。是用于准备、运行和排查复杂生物信息学流程的理想选择。

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