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LabArchives电子实验记录本API集成

labarchive-integration
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
468
此技能提供与LabArchives电子实验记录本（ELN）的全面API集成，用于自动化复杂的科学研究流程。核心功能包括笔记本管理、条目创建、附件上传、数据备份和生成详细的站点报告。适用于科研数据管理和与外部工具的集成。
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生物学数据谱系湖仓

lamindb
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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LaminDB是一个开源的生物学领域谱系原生湖仓，用于管理和分析复杂的生物数据集和计算工作流。它使多种科学数据（如scRNA-seq, AnnData）具备可查询性、可追溯性并符合FAIR原则。核心功能包括强大的数据谱系跟踪、基于本体的注释和模式验证，支持在多云/本地存储系统上进行统一查询，适用于生物信息学研究。
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专业市场研究报告生成器

market-research-reports
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
243
该技能可生成专业级、篇幅超过50页的综合市场研究报告，风格对标麦肯锡、BCG等顶级咨询公司。它集成了市场数据检索、LaTeX专业排版，并支持多维度的战略分析框架（如波特五力、SWOT、PESTLE、TAM/SAM/SOM），适用于商业决策、投资分析和尽职调查。
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药物化学化合物筛选工具

medchem
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这是一个用于药物发现领域的专业工具，提供全面的药物化学过滤功能。它能够基于药代动力学（如Lipinski规则）、结构警报（如PAINS, NIBR）和分子复杂性等多个维度，对化合物库进行高效筛选和优先级排序，帮助研究人员从大量化合物中筛选出有前景的候选药物。
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分子动力学模拟流程

molecular-dynamics
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本技能提供分子动力学模拟的完整工作流程，涵盖了系统构建、势场定义、能量最小化和平衡化过程。使用OpenMM和MDAnalysis等专业工具，适用于蛋白质结构稳定性分析、药物结合建模及生物物理学研究。
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综合生物信号处理工具箱

neurokit2
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本工具箱是一个全面的生理信号分析平台，可处理心电图(ECG)、脑电图(EEG)、皮肤电导(EDA)等多类型生物信号。它支持心率变异性分析、脑状态识别、自主神经系统评估等高级分析，广泛应用于心理生理学和临床研究。
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自托管AI研究笔记与知识库

open-notebook
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Open Notebook是一款强大的开源自托管工具，是Google NotebookLM的替代品。它允许用户汇集PDF、视频、网页等多种资料，建立AI驱动的知识库。核心功能包括上下文聊天、向量搜索、多说话人播客生成和完整的REST API接口。所有数据均在用户本地私有化运行，确保最高级别的数据隐私安全。
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学术论文同行评审与评估

peer-review
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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本技能提供一套结构化、系统的学术同行评审流程，用于评估科学论文和基金申请。它涵盖了从研究背景、实验设计、统计分析到结果报告等各个关键环节的严格审查。用户可利用它对稿件进行深度评阅，确保科学严谨性、可重复性和报告标准合规性，并给出建设性修改意见。
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系统发生树构建与分析工具包

phylogenetics
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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本工具包提供完整的系统发生学分析流程，涵盖序列比对、数据精修和树状图构建。集成了MAFFT进行多序列比对，IQ-TREE 2和FastTree进行最大似然树推断。适用于分子基因组学、病毒进化追踪、蛋白质家族分析和分子时钟研究等领域，实现自动化生物信息学分析。
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精准医疗知识图谱查询

primekg
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
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PrimeKG是一个集成超过20个数据库的综合知识图谱，用于绘制复杂的生物关系。它可以查询包括基因、药物、疾病和表型在内的多尺度数据，是进行药物发现、寻找药物重定位机会以及进行网络药理学研究的强大工具。
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Protocols.io科学协议管理集成

protocolsio-integration
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提供完整的protocols.io API v3编程接口，用于科学协议的完整生命周期管理。可用于协议的发现、协作开发、步骤编辑、文件上传、实验记录和工作空间组织。适用于生物信息学、学术研究工具和科学文献自动化流程。
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多目标优化框架

pymoo
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Pymoo是一个强大的Python优化框架，专注于解决具有多个相互冲突目标的优化问题。它集成了NSGA-II、NSGA-III等先进的进化算法，能够高效地寻找帕累托最优解集（Pareto fronts），帮助用户分析不同目标之间的取舍关系（Trade-offs）。适用于工程设计、科学研究和复杂约束优化场景。
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