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UniProt数据库接口
uniprot-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
275
通过 UniProt REST API 搜索蛋白质、获取 FASTA 与注释、执行 ID 映射并流式下载,适合 Python 工作流和批量分析。
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金柿云实验室自动化
ginkgo-cloud-lab
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
324
通过 Ginkgo Cloud Lab 提交并管理实验协议,利用可配置的自动化小车完成无细胞蛋白表达、荧光像素艺术等项目,并借助 EstiMate AI 评估与报价,覆盖样本准备与下单流程。
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糖链工程工具集
glycoengineering
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
251
对蛋白序列进行N-和O-糖基化位点分析,提供筛查、添加或消除糖基化位点的策略,辅助抗体优化、疫苗设计及生物类似物糖链比对。
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InterPro蛋白注释工具
interpro-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
174
通过 InterPro REST API 与 Python 示例快速查询蛋白家族、结构域、功能位点等信息,支持功能预测、结构域组合分析以及 GO 注释,服务于蛋白组注释或进化研究流程。
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分子动力学工具
molecular-dynamics
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
73
利用 OpenMM 与 MDAnalysis 建立蛋白或小分子体系,执行能量最小化、均衡和轨迹分析(RMSD、RMSF、接触图与自由能面),为结构生物学与药物结合研究提供数据支撑。
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系统发生树重建与分析工具包
phylogenetics
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
275
这是一个完整的系统发生学分析流程,用于重建生物序列(基因、蛋白质)的进化关系。流程涵盖了从多序列比对(MAFFT)到最大似然树构建(IQ-TREE 2),再到可视化和分析(ETE3)的完整生命周期。适用于病毒动力学、微生物基因组学、分子时钟分析等前沿生物信息学研究。
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UniProt蛋白数据库API
uniprot-database
sickn33/antigravity-awesome-skills
495
通过 UniProt REST 接口,支持蛋白搜索、FASTA/注释获取、标识符映射以及大批量数据流式下载,方便程序化处理蛋白信息。
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