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GEO基因表达提取器

geo-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
65
连接NCBI GEO仓库，通过Entrez搜索GSE/GSM/GPL/Profiles，获取基因表达数据、实验设计和矩阵文件，配合GEOparse下载分析所需的转录组资料。
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视频媒体AI生成与编辑

videodb-skills
sickn33/antigravity-awesome-skills
386
这是一个全面的视频内容创作工具，支持从YouTube、本地文件等多种来源上传视频。它提供实时流媒体、语义搜索和复杂的编辑工作流。核心功能包括AI转录、自动字幕生成、精细剪辑，并能利用AI能力生成图像、背景音乐、音效和配音，是内容创作者和媒体工作者的理想选择。
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JASPAR转录因子结合位点工具

jaspar-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
184
通过调用 JASPAR API 和 Python 工具，获取 TF 结合模型、将 PFM 转为 PWM 并在 DNA 序列中扫描高置信度的结合位点，辅助调控变异注释、ChIP/ATAC 解读及转录因子网络构建。
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scVelo RNA速度轨迹分析

scvelo
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
339
面向单细胞 RNA-seq 的 RNA 速度分析工具包，通过建模未剪接/已剪接转录本动力学推断细胞分化方向、潜在时间和驱动基因，可与 Scanpy 流程联动。
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会议洞察分析器

meeting-analyzer
alirezarezvani/claude-skills
227
对会议转录或录音进行结构化处理，分析说话比例、冲突回避、填充词与问话质量，配合工具提示，帮助用户获取沟通与带节奏的具体反馈。
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快速内容摘要工具

summarize
volcengine/OpenViking
425
命令行工具，可提取网址、本地文件、播客和视频的内容，生成摘要或转录，支持模型 API、长度控制及提取回退，非常适合快速理解长格式素材。
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基因调控网络推断

arboreto
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
55
Arboreto是一个强大的Python库，用于从各种基因表达数据集（如单细胞或批量RNA-seq）推断基因调控网络（GRN）。它利用GRNBoost2和GENIE3等算法，识别转录因子与目标基因之间的关键调控关系。支持Dask分布式计算，适用于大规模高通量转录组学分析。
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细胞图谱数据查询与分析

cellxgene-census
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
225
该技能提供对CZ CELLxGENE大型公共单细胞和空间转录组学数据的程序化访问。用户无需下载整个数据集，即可按细胞类型、组织、疾病等维度进行高效查询，获取基因表达矩阵、元数据和预计算的嵌入信息。适用于大规模、跨数据集的生物学研究和模型训练。
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单细胞组学生成模型工具箱

scvi-tools
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
149
这是一个基于深度生成模型和变分推断的综合性Python框架，用于先进的单细胞组学分析。它支持单细胞RNA-seq、ATAC-seq、CITE-seq以及空间转录组等多种多模态数据的深度整合与分析。核心功能包括概率批次校正、细胞类型注释和多组学整合。
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AssemblyAI SDK 安装与配置

assemblyai-install-auth
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
395
本指南提供了在Node.js和Python环境中配置AssemblyAI SDK的完整步骤。内容涵盖了SDK的安装、使用环境变量进行安全的API密钥管理，以及客户端初始化，确保用户能够成功接入转录和流媒体等AI服务。
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Fathom AI会议集成部署

fathom-deploy-integration
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
89
本技能提供了一套完整的Fathom AI会议集成部署方案。它使用Docker容器化技术，构建了一个服务来接收和处理Fathom API传输的会议转录、摘要和行动项等数据。方案内容涵盖了环境配置、健康检查以及滚动更新策略，确保了会议数据流的稳定性和持续同步性。
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Fathom本地开发与测试环境

fathom-local-dev-loop
jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills
90
提供了一个本地化的开发环境，用于集成和测试Fathom API相关的会议分析工具。开发者可以使用内置的模拟会议和转录数据，无需依赖真实API调用，从而安全地构建和迭代转录处理流程和Webhook处理逻辑，适用于项目初期开发和单元测试。
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