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临床试验数据库查询
clinicaltrials-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
324
通过 ClinicalTrials.gov API v2 按疾病、药物、地点、赞助商或状态查询试验,按 NCT 编号提取详细数据并导出用于研究分析、患者匹配或试验监控。
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ClinVar 变异临床意义查询
clinvar-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
442
查询ClinVar数据库以获取变异临床意义,通过网页/API访问、FTP批量下载并注释VCF,辅助基因组医学解读。
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Dask 大数据并行处理
dask
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
395
Dask 是 Python 库,通过并行化 DataFrame、Array、Bag 以及自定义任务,把 pandas/NumPy 工作流扩展到超出内存的规模,可在多核或集群上完成 ETL、日志处理和分布式 ML。
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分子机器学习工具集
deepchem
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
229
DeepChem 是面向化学与生物的 Python 机器学习库,提供分子特征化、数据加载、拆分和模型训练能力,可快速用于属性、毒性、蛋白质或材料性质预测。
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EDGAR 数据提取器
edgartools
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
59
基于 Python 的库,访问并解析 SEC EDGAR 报送文件,提取 XBRL 财务表、Form4、13F 等结构化数据,支持 10-K/10-Q/8-K/DEF14A 等多种申报分析与公司筛选。
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GeoPandas 空间分析库
geopandas
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
419
GeoPandas 基于 pandas 和 shapely,处理地理矢量数据(SHP/GeoJSON/GeoPackage/PostGIS),支持坐标系转换、空间连接、叠置、缓冲、面积距离计算及静态与交互式地图,适用于各类空间分析流程。
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基因组区间工具库
gtars
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
203
高性能 Rust 工具库(含 Python 绑定),面向基因组区间分析,支持重叠检测、覆盖轨道、ML 标记化、参考序列管理、片段拆分与评分等常见测序数据流程。
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人类代谢物数据库查询
hmdb-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
493
通过 HMDB 检索 22 万余条人类代谢物信息,可按名称、ID、结构、疾病、标本筛选,获取化学、临床、通路和谱图数据并批量下载,支持代谢组学研究与生物标志物分析。
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KEGG REST 工具集
kegg-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
447
提供 KEGG REST API 的 Python 工具,涵盖数据库信息、列表、检索、搜索、ID 转换、关联与药物交互,帮助完成通路与基因组分析。
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系统化文献综述助手
literature-review
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
70
采用多数据库、系统化流程开展文献综述,核实引用、支持APA/Nature等样式,并生成 AI 结构图,输出专业的 Markdown/PDF 文档,适用于医学、科学与工程研究。
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医药化学筛选工具
medchem
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
219
Medchem 是面向药物发现的 Python 库,提供药性规则、结构警报、官能团检测、标准目录、复杂度评估与自定义约束,帮助批量筛选化合物库并优先挑选候选分子。
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分子特征化中心
molfeat
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
255
Molfeat 是一个 Python 库,集成 100+ 分子特征器、转换器与预训练模型,用于 QSAR、虚拟筛选、相似性搜索和深度学习等分子 ML 场景。
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