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SwanLab 实验跟踪

experiment-tracking-swanlab

Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs

介绍如何使用 SwanLab 进行开源机器学习实验跟踪，提供本地或自托管的仪表盘、丰富的媒体日志，并与 PyTorch、Transformers、Lightning、Fastai 等框架集成，便于对比各次训练。

Polars Bio基因组工具

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polars-bio 依托 Polars、Arrow 与 DataFusion，提供高性能基因组区间运算、BED/VCF/BAM/CRAM/GFF/FASTA 等生信文件读写、SQL 查询及流式处理，适合云存储与大文件场景，可替代 bioframe。

UniProt蛋白质数据库查询与分析

uniprot-database

sickn33/antigravity-awesome-skills

用于访问和查询UniProt蛋白质数据库，这是蛋白质序列和功能信息领域的权威资源。支持通过名称、基因或访问号搜索蛋白质，检索FASTA格式序列，实现跨数据库ID映射（如Ensembl, RefSeq），并分析GO术语等功能注释，是生物信息学数据分析的核心工具。

综合分子生物学工具包

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Biopython是基于Python的综合性计算分子生物学工具包，功能强大。它用于处理生物序列（DNA、RNA、蛋白质），解析FASTA、GenBank、PDB等标准生物学文件格式，并支持程序化访问NCBI等大型数据库。适用于构建复杂的生物信息学流程，如序列比对、结构分析和系统发育树构建。

DeepChem：分子结构与化学计算

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DeepChem是一个综合性的Python库，专为将机器学习应用于化学、材料科学和生物学等领域设计。它支持分子属性预测（如ADMET、毒性），利用图神经网络（GNNs）训练模型，并处理多种分子数据格式（SMILES, SDF）。该库提供了丰富的特征化选项，是药物发现和计算化学研究的强大基础工具。

综合科学数据探索分析

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适用于分析任何专业的科学数据文件。支持超过200种主流格式，涵盖化学、生物信息学、显微成像、光谱学等多个领域。它能够自动识别文件类型，评估数据质量和结构，并生成详细的Markdown报告，为用户提供深入的洞察和后续分析建议。

基因组数据处理与分析

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Pysam是一个专业的基因组数据处理Python模块。它提供了一个Python接口，用于读写和操作主流基因组格式，包括BAM/CRAM比对文件、VCF/BCF变异文件和FASTA/FASTQ序列。广泛应用于基因组测序分析、变异检测、覆盖度计算以及构建复杂的生物信息学流程。

生物信息学数据分析工具

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这是一个全面的Python生物信息学工具包，用于处理和分析生物学数据。核心功能包括DNA/RNA/蛋白质序列操作、配对和多重序列比对、构建和分析系统发育树，以及计算Alpha/Beta多样性等生态学指标。适用于微生物组学分析、进化学研究和各种生物数据处理，支持FASTA、Newick等标准格式。

LangGraph生产级流式传输指南

langchain-langgraph-streaming

jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills

本指南解决了LangGraph流式传输中的三大工程痛点：状态冗余、代理缓冲和事件噪声。它提供了一个生产级的FastAPI实现方案，指导用户如何正确选择`stream_mode`，并内置了防缓冲机制和服务器端事件过滤。确保无论部署在何种代理环境，都能稳定可靠地实现实时Token流和节点状态展示，适用于构建高性能的聊天UI。

FastAPI生产级最佳实践模式

fastapi-patterns

affaan-m/everything-claude-code

本指南提供了一套用于构建生产级、可扩展FastAPI API的架构模式和最佳实践。内容涵盖了清晰的项目结构划分、使用依赖注入管理数据库会话和认证、通过Pydantic定义请求和响应模型，以及处理异步I/O操作等关键环节，确保代码的健壮性和可维护性。

Python项目架构搭建

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sickn33/antigravity-awesome-skills

该技能模拟一位专业的Python项目架构专家，专门用于从零开始搭建完整的、生产级别的应用结构。它支持使用现代工具（如FastAPI、Django、uv），生成包含最新最佳实践和类型提示的完整项目骨架。

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