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FHIR术语服务查询与编码
querying-terminology-service
maziyarpanahi/openmed
392
该技能用于连接OpenMed提取的文本实体与最终的FHIR编码输出。通过调用用户持牌的FHIR术语服务器,实现临床代码的验证、值集扩展、代码查询和系统间映射(如ICD-10到SNOMED)。确保文本跨度能被转化为结构化、经过标准确认的编码概念,是医疗数据互操作性的关键环节。
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OpenMed设备端本地部署指南
running-openmed-ondevice
maziyarpanahi/openmed
233
本指南详细介绍了如何在本地设备端部署OpenMed模型,以确保最高级别的隐私保护。它涵盖了使用三种后端(MLX用于Apple Silicon,CoreML用于iOS/macOS,ONNX/WebGPU用于跨平台/浏览器)的工作流。部署流程包括模型转换、可选的量化处理和本地运行,保证受保护的健康信息(PHI)不会离开设备。
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零样本生物医学实体抽取
running-zeroshot-ner
maziyarpanahi/openmed
239
零样本命名实体识别(NER)工具,可从临床或生物医学文本中提取自定义实体类型(如药物、症状),无需预设标签或进行模型微调。它利用GLiNER/GLiNER2模型,用户可以在运行时定义所需标签。通过构建模型索引和运行推理,适用于快速原型开发或标签结构不稳定的场景。
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构建SMART on FHIR用于临床AI
scaffolding-smart-on-fhir
maziyarpanahi/openmed
152
本指南提供将OpenMed驱动的工具嵌入到Epic、Cerner等电子健康记录(EHR)的完整流程。它涵盖了SMART on FHIR的全过程,包括OAuth2 PKCE授权、细粒度范围限定(如patient/DocumentReference.rs)、安全令牌处理,以及在设备本地对临床笔记进行去身份化和命名实体识别(NER)处理。
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OpenMed临床NLP REST API部署
serving-openmed-rest-api
maziyarpanahi/openmed
233
本技能提供OpenMed的FastAPI RESTful服务,用于构建自托管的临床NLP微服务。它核心功能包括临床命名实体识别(NER)、个人身份信息(PII)提取和去识别化处理。适用于需要将模型部署为内部API、进行批处理或构建安全推理层级的场景,支持模型生命周期管理和动态批处理。
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