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学术成果发展性评审

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K-Dense-AI/scientific-agent-skills
381
对学术作品提供以定性判断为先、证据可追溯的发展性评审，并审计低风险研究评估量规，内置本地质量控制。禁止用于人员排名或重大决策。
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科学头脑风暴引导

scientific-brainstorming
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
114
用于引导循证的科学创意构思：独立产出、结构化讨论、显式假设、透明评估、对抗性评审与决策日志。适用于早期科研头脑风暴和候选方向优先级排序；实证验证、研究设计及伦理审查需交由相关专家或技能。
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科学批判性思维

scientific-critical-thinking
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
344
运用 GRADE 与 Cochrane 偏倚风险评估框架，系统评价科研主张、实验设计与证据质量。帮助识别选择偏倚、混杂因素、统计陷阱与逻辑谬误，并对研究论文给出结构化的建设性批判分析。
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科研示意图生成器

scientific-schematics
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
163
用自然语言描述即可生成出版级科研示意图，基于 Nano Banana 2 AI 绘制，并由 Gemini 按文档类型阈值自动评审与智能迭代。适用于神经网络架构图、系统框图、流程图、生物信号通路及学术海报配图。
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科研演示幻灯片制作

scientific-slides
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
220
为学术会议、研讨会、答辩等科研场景制作专业幻灯片，提供结构规划、设计模板、时间把控、引用规范与可视化校验，支持 PowerPoint 和 LaTeX Beamer。
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科学可视化

scientific-visualization
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
286
使用 Matplotlib、Seaborn 或 Plotly 创建真实、可访问、可发表的科研图表。确保数据完整性、正确编码、可访问性合规和期刊导出规划。包括不确定性显示、颜色对比审查和元数据验证指南。
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科学论文写作

scientific-writing
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
132
起草、修订和审核科学论文或报告，强调证据溯源、报告规范覆盖、署名责任、保密控制和一致性检查。适用于论文各部分、参考文献、声明、图表或投稿准备。
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scikit-bio 生物信息学工具包

scikit-bio
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
183
用于生物数据分析的 Python 工具包，支持生物序列读写与操作、成对及多序列比对、系统发育树构建、α/β 多样性与 UniFrac 距离、PCoA 排序分析、PERMANOVA 等统计检验，以及 FASTA/Newick/BIOM 格式读写，广泛用于微生物组与群落生态研究。
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Scikit-learn 机器学习

scikit-learn
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485
提供使用 scikit-learn 进行机器学习的全面指南，涵盖分类、回归、聚类、预处理、模型评估和流水线构建，适用于构建生产级机器学习工作流。
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scikit-survival 生存分析实战

scikit-survival
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450
基于 scikit-survival 0.28.0 构建、评估与审查右删失或竞争风险生存分析流程，涵盖防泄漏预处理管道、嵌套模型选择、Cox 与机器学习模型、时变概率预测，以及 IPCW 一致性、动态 AUC、Brier 评分等删失感知指标。
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scVelo RNA速率分析

scvelo
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360
scVelo 是用于单细胞 RNA 测序的 RNA 速率分析 Python 包，通过未剪接/剪接 mRNA 动力学估计细胞状态转变，推断轨迹方向，计算潜在时间并识别驱动基因，揭示细胞命运决定。
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单细胞基因组深度学习工具

scvi-tools
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426
scvi-tools 是一个全面的 Python 框架，用于单细胞基因组学中的概率深度学习模型。基于 PyTorch 和 PyTorch Lightning 构建，支持批次校正、迁移学习、带不确定性的差异表达分析和多模态数据整合。适用于单细胞 RNA-seq、ATAC-seq、CITE-seq、空间转录组学及甲基化、流式细胞术等专用模态的高级建模分析。
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