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Adaptyv 蛋白质实验平台

adaptyv
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
212
引导如何使用 Adaptyv Bio Foundry API 与 Python SDK 设计蛋白实验、提交序列、自动化流程，并获取 BLI/SPR 与热稳定性等检测结果，适合需要采集实验数据的开发者与科研人员。
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智能代理行动审计

agentic-actions-auditor
trailofbits/skills
187
审计调用AI编码代理的GitHub Actions工作流，识别提示注入、沙箱配置与环境变量等路径中的受攻击者可控输入，帮助评估CI/CD流水线安全并防止代理能力滥用。
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Benchling 实验室集成套件

benchling-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
266
通过 Benchling SDK/REST 管理 DNA/RNA/蛋白等注册实体、库存、ELN、流程与数据仓库查询，实现实验室数据同步与自动化。
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Biopython分子生物工具包

biopython
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
303
Biopython 提供序列操作、数据库访问、BLAST 自动化、结构生物信息和系统发育等功能，适合用于编写定制流水线和批量处理的计算分子生物学任务。
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科学资源检测

get-available-resources
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
490
在进行科学计算前检测 CPU、GPU、内存与磁盘状态，并生成 `.claude_resources.json` 包含并行、异步、GPU 加速等策略建议，帮助选择恰当的计算方式。
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LabArchives 实验笔记本集成

labarchive-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
186
通过 LabArchives API 自动化管理电子实验笔记本，包括凭证配置、条目/附件操作、备份、报表和 Protocols.io/Jupyter/REDCap 等集成，助力科研数据工作流。
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Latch 生物信息工作流

latchbio-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
264
LatchBio Integration 提供 Python 为核心的服务器化生物信息流程构建与部署能力，涵盖装饰器任务、LatchFile/Dir 云存储、GPU 资源调优，以及与 Nextflow/Snakemake 等管道的互通，适合 RNA-seq、AlphaFold 等分析场景。
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Markdown与Mermaid文档规范

markdown-mermaid-writing
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
313
将 Markdown 与 Mermaid 设为科研与技术文档的默认格式，涵盖 24 种图表参考与 9 个模板，确保报告、分析或说明既可版本控制，又可直接渲染。
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MarkItDown 文档转 Markdown

markitdown
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
106
MarkItDown 将 PDF、Office、HTML、JSON、XML、ZIP、图片（带 OCR）和音频（语音转写）等多种格式统一转为结构化 Markdown，便于与大模型或文档流程协作。
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MATLAB/Octave 科学计算指南

matlab
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
302
提供 MATLAB 与 GNU Octave 的矩阵计算、数据导入导出、图形绘制、统计分析、信号与微分方程等科学计算指导，适用于编写、调试或在两个解释器间转换脚本。
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OMERO显微镜数据集成

omero-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
60
通过 OMERO Python API 管理显微镜数据：访问项目/数据集/图像、分析像素、运维 ROI 与注释、保存表格结果，并支持高内涵筛选的批处理自动化流程。
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Opentrons协议自动化集成

opentrons-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
167
提供官方 Opentrons Protocol API v2 接口，支持在 OT-2 与 Flex 机器人上编写 Python 协议，自动化液体处理、模块控制、上样板配置与复杂移液流程，并在执行前模拟测试。
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