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Markdown与Mermaid文档规范

markdown-mermaid-writing
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
313
将 Markdown 与 Mermaid 设为科研与技术文档的默认格式，涵盖 24 种图表参考与 9 个模板，确保报告、分析或说明既可版本控制，又可直接渲染。
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MarkItDown 文档转 Markdown

markitdown
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
106
MarkItDown 将 PDF、Office、HTML、JSON、XML、ZIP、图片（带 OCR）和音频（语音转写）等多种格式统一转为结构化 Markdown，便于与大模型或文档流程协作。
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MATLAB/Octave 科学计算指南

matlab
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302
提供 MATLAB 与 GNU Octave 的矩阵计算、数据导入导出、图形绘制、统计分析、信号与微分方程等科学计算指导，适用于编写、调试或在两个解释器间转换脚本。
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OMERO显微镜数据集成

omero-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
60
通过 OMERO Python API 管理显微镜数据：访问项目/数据集/图像、分析像素、运维 ROI 与注释、保存表格结果，并支持高内涵筛选的批处理自动化流程。
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Opentrons协议自动化集成

opentrons-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
167
提供官方 Opentrons Protocol API v2 接口，支持在 OT-2 与 Flex 机器人上编写 Python 协议，自动化液体处理、模块控制、上样板配置与复杂移液流程，并在执行前模拟测试。
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Protocols.io科学协议自动化集成

protocolsio-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
464
本技能提供与Protocols.io API v3的完整编程集成，用于管理科学协议的整个生命周期。用户可以使用它来搜索、创建、更新和发布科学协议，管理实验步骤和材料，支持团队协作开发，组织工作空间，并进行实验跟踪。适用于构建自动化实验室流程和科学文档系统。
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PubChem 化学数据库查询

pubchem-database
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322
通过 PUG-REST API 或 PubChemPy 查询 PubChem 百万化合物库，按名称、CID 或结构检索性质、相似性/子结构、活性数据，并支持格式互转，适用于化学信息分析与药物筛选。
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Python实验室机器人自动化框架

pylabrobot
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
153
PyLabRobot是一个纯Python、厂商无关的实验室自动化开发工具包。它提供了一个统一的接口，用于控制各种实验室设备，如液体处理机器人（Hamilton, Opentrons, Tecan）、读板机、泵、摇架和培养箱。适用于构建复杂、多设备、可复现的自动化实验流程，并支持离线仿真。
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PyOpenMS 质谱分析平台

pyopenms
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PyOpenMS 通过 Python 封装 OpenMS，支持 mzML 等格式读取、信号处理、特征和肽段/蛋白鉴定、定量及代谢组分析等质谱计算流程。
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PyTorch Lightning 框架

pytorch-lightning
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PyTorch Lightning 框架将 PyTorch 代码组织为 LightningModule/DataModule、Trainer、回调、日志与分布式策略，便于多 GPU/TPU 训练、实验记录和项目级别扩展。
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量子计算开发框架

qiskit
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Qiskit 是世界领先的开源量子计算框架，用于构建、优化和执行量子电路。它提供全面的功能，支持在IBM Quantum等多种硬件后端运行量子算法，并包含量子纠错、化学模拟和机器学习等领域的应用模块，是量子计算领域研究人员的必备工具。
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科研信息查询

research-lookup
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231
实时科研信息查询，智能选择 Parallel Chat API 与 Perplexity 声纳学术搜索，搜集论文、数据、趋势与验证资料并提供引用。
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