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PathML 病理计算工具包

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PathML 是用于计算病理的 Python 工具集，支持多种切片格式、H&E 预处理、图谱构建和 HoVer-Net/HACTNet 训练，方便多重免疫荧光及空间蛋白组分析与管理。

PrimeKG精准医学图谱查询

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通过程序化脚本查询PrimeKG精准医学知识图谱的基因、药物、疾病与表型等实体及其关系，辅助药物发现、可复用性验证与表型网络分析。

使用Malpedia分析恶意软件家族关系

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mukul975/Anthropic-Cybersecurity-Skills

本技能指导如何利用Malpedia API进行高级恶意软件情报分析。用户可以追踪恶意软件家族关系，分析变种演变，提取用于检测的YARA规则，并绘制与特定威胁行为者的关联图谱。适用于安全研究人员和SOC分析师构建威胁模型。

对抗方基础设施追踪系统

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mukul975/Anthropic-Cybersecurity-Skills

该系统用于自动化追踪并绘制敌对威胁行为者的C2网络图谱。通过整合被动DNS、WHOIS数据、证书透明度和IP富集等多种数据源，实现基础设施的交叉引爆（Pivoting），帮助安全分析师发现共享托管模式、监控域名重用，并构建完整的威胁情报关系图谱。

进程注入技术检测与溯源

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mukul975/Anthropic-Cybersecurity-Skills

本技能提供了一个结构化的安全检测流程，用于检测进程注入技术（MITRE ATT&CK T1055）。它通过分析详细日志，特别是利用Sysmon事件ID 8（CreateRemoteThread）和事件ID 10（ProcessAccess），结合源-目标进程关系图谱，以识别恶意越权的行为，帮助安全分析师进行安全事件调查和威胁狩猎。

社交图谱加权排名分析

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affaan-m/everything-claude-code

这是一个先进的网络情报工具，用于计算加权图谱分数，描绘到达目标的最优路径。它能够识别潜在的引荐人，衡量跨连接的“桥梁价值”，并帮助用户判断是否需要温和引荐或直接外联。对于需要掌握核心排名数学原理的用户尤其适用。

deepTools：高通量测序数据分析工具

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deepTools是一款全面的命令行工具包，用于处理和分析高通量测序（NGS）数据。它提供了核心功能，支持质量控制（QC）、数据标准化、样本比较以及生成出版级别的可视化图表。适用于ChIP-seq、RNA-seq和ATAC-seq等各类实验，可将BAM文件转换为bigWig图谱，并进行PCA分析和热图绘制。

癌症依赖图谱分析工具

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该工具提供癌症依赖图谱（DepMap）数据接口，基于全基因组CRISPR筛选、RNAi和化合物敏感性实验。可用于查询基因的依赖性评分，识别特定于癌症的脆弱点，预测合成致死作用，并验证肿瘤学药物靶点。

计算病理学分析工具包

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PathML是一个全面的Python工具包，用于先进的计算病理学工作流。它支持从160多种专有格式加载全玻片图像（WSI），并提供图像预处理（染色归一化、组织检测）、构建空间细胞/组织图谱以及训练深度学习模型（如HoVer-Net）的能力。尤其适用于分析CODEX和Vectra等多参数免疫荧光数据。

谷歌搜索结构化数据提取

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jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills

该工作流利用SerpApi全面爬取和提取谷歌搜索结果的结构化数据。它能捕捉到有机结果、知识图谱、答案框、相关问题（PAA）和本地商家信息等所有关键组成部分。适用于SEO监测、市场调研、竞品分析或开发需要深度结构化数据洞察的搜索功能。

arXiv科研论文服务器

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blazickjp/arxiv-mcp-server

这是一个提供科研级访问的综合服务器，可用于学术研究和文献综述。用户可以按主题、作者或日期搜索论文，下载全文，并通过追踪引文图谱来分析知识体系。此外，它还支持本地语义搜索和新论文监控警报，极大地提升了研究效率。

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