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搜索 工具 ，共找到 39 条记录
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Aeon时序机器学习工具包

aeon
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286
Aeon是一套兼容scikit-learn的时序机器学习工具，涵盖分类、回归、聚类、预测、异常检测、分段、相似性搜索与特征工程等应用。
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生物Python分子工具

biopython
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280
Biopython 是一套完整的 Python 分子生物工具，支持序列操作、文件格式转换、NCBI 接入、BLAST 自动化、结构解析与系统发育分析，适合构建生物信息流程与批量任务。
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COBRApy 代谢建模工具

cobrapy
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384
COBRApy 是用于约束代谢模型重建与分析的 Python 库，涵盖模型导入导出、FBA/FVA、基因与反应敲除、通量采样与生产包络分析，适合系统生物学与代谢工程研究。
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分子机器学习工具集

deepchem
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DeepChem 是一个用于分子机器学习的 Python 库，提供数据加载、特征化、切分和建模功能，方便快速构建分子属性预测、MoleculeNet 基准测试以及药物发现和材料设计流程。
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deepTools 高通量测序分析

deeptools
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deepTools 提供 Python 命令行工具集，用于 BAM 转 bigWig、QC、相关性分析及热图和富集等 ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq 可视化分析。
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系统发育树工具包

etetoolkit
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450
ETE 工具包提供系统发育树操作、进化事件检测、NCBI 分类信息集成以及高质量图形化展示，助力系统发育组学研究与聚类分析。
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GeoPandas空间分析工具

geopandas
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GeoPandas 在 pandas 基础上提供地理矢量数据处理能力，可读写多种格式、投影、空间连接与叠加、缓冲与可视化，适合街区分析、地图制作与 PostGIS 集成工作。
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Gtars基因组分析工具

gtars
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324
Gtars 是一个高性能 Rust 工具包，配套 Python 绑定，用于基因组区间分析，涵盖重叠检测、覆盖曲线生成、机器学习 token 化、片段打分与参考序列管理等计算基因组学场景。
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KEGG REST 工具集

kegg-database
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279
提供 KEGG REST API 的 Python 工具，涵盖数据库信息、列表、检索、搜索、ID 转换、关联与药物交互，帮助完成通路与基因组分析。
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生理信号处理工具

neurokit2
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479
NeuroKit2 是面向 ECG、EEG、EDA、RSP、PPG、EMG、EOG 等多种生理信号的 Python 工具包，可用于心率变异、事件相关电位、复杂性、交感副交感评估及多模态融合研究。
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Neuropixels 神经电生理分析

neuropixels-analysis
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面向 Neuropixels 高密度电生理的全栈分析工具，覆盖 SpikeGLX/Open Ephys/NWB 数据加载、预处理、漂移校正、Kilosort4 及替代排序、质量指标统计、Allen/IBL 策略整合的元件整编、可视化输出及 Phy/NWB 结果导出。
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病理切片分析工具

pathml
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PathML 是面向计算型病理的 Python 工具，支持整张切片读取、染色预处理、空间图谱构建以及多参数免疫荧光数据的机器学习分析。
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