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Ray数据处理平台

Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs

Ray Data 提供可扩展的分布式数据处理，支持 CPU/GPU 流式执行，兼容 Parquet、CSV、JSON、图像等多模态，集成 PyTorch、TensorFlow、Ray Train，适合批量推理、ETL 与大规模预处理。

模式优化工作流编排器

schema-optimization-orchestrator

jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills

这是一个高级的工作流编排器，用于对大型数据集（如BigQuery导出数据）执行多阶段的模式优化分析。它系统地识别冗余字段、未用字段和数据结构缺陷，评估优化变动带来的风险和潜在节省，最终输出包含详细优化建议的综合报告。

数据集划分助手

splitting-datasets

jeremylongshore/claude-code-plugins-plus-skills

该技能自动生成并执行 Python 代码，将数据集按指定比例划分为训练、验证与测试集，方便机器学习模型的训练与评估。

机器学习模型训练

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自动化完成机器学习模型的训练流程，包括数据分析、模型类型选择、参数配置、交叉验证训练、性能评估以及生成可复用的模型产物，适用于需要训练或评估数据集的场景。

LinkedIn自动化CLI工具

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这是一个用于通过命令行界面（CLI）自动化LinkedIn操作的工具。它支持批量获取个人和公司资料、搜索人脉、管理连接和发送消息。特别适用于构建自动化工作流、进行数据挖掘或集成到AI代理脚本中，无需手动操作网页界面，输出结果结构化JSON。

DNAnexus 云基因组集成

dnanexus-integration

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通过 DNAnexus 云基因组平台开发 app/applet、管理 FASTQ/BAM/VCF 等数据、运行工作流，并使用 dxpy 自动化脚本，支撑生物医学流水线。

Histolab 全切片瓦片处理

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Histolab 为全切片图像提供自动化组织检测、瓦片抽取和染色标准化，方便快速构建数据集和进行瓦片级分析，适用于轻量化病理图像处理流程。

KEGG REST 工具集

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提供 KEGG REST API 的 Python 工具，涵盖数据库信息、列表、检索、搜索、ID 转换、关联与药物交互，帮助完成通路与基因组分析。

LaminDB生物数据平台

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LaminDB 是一款面向生物数据的开放平台，提供从数据集管理、谱系追踪到本体注释、模式校验与工作流集成的全链路能力，帮助科研团队打造可查询、可复现的 FAIR 数据湖仓。

DICOM 医疗影像工具

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Pydicom 提供 Python 接口，方便读取、写入和修改 DICOM 医疗影像文件，支持像素提取、元数据管理、匿名化、格式转换以及与 PACS 流程的集成，适用于医学影像分析和放射科应用。

Reactome 通路分析助手

reactome-database

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调用 Reactome 内容与分析服务（或 reactome2py 客户端）获取通路层级、基因映射、富集/表达分析与疾病机制数据，辅助系统生物学研究。

Scikit 生存分析

scikit-survival

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基于 scikit-survival 的 Python 生存分析工具，涵盖 Cox、集成模型、SVM 与指标评估，便于处理删失数据的时间事件建模。

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