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ChEMBL 生物活性查询
chembl-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
260
通过 ChEMBL Python 客户端访问化合物、靶点、活性与药物数据,按结构/性质/活性过滤,支撑抑制剂发现与 SAR 分析。
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临床试验数据库查询
clinicaltrials-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
324
通过 ClinicalTrials.gov API v2 按疾病、药物、地点、赞助商或状态查询试验,按 NCT 编号提取详细数据并导出用于研究分析、患者匹配或试验监控。
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ClinPGx 药物基因组数据库
clinpgx-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
210
通过 ClinPGx REST API 查询基因-药物关系、CPIC/DPWG/FDA 指南、等位基因功能与频率等临床药物基因组数据,支持个体化用药与临床决策。
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ClinVar 变异临床意义查询
clinvar-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
442
查询ClinVar数据库以获取变异临床意义,通过网页/API访问、FTP批量下载并注释VCF,辅助基因组医学解读。
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COSMIC癌症突变数据访问
cosmic-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
111
通过认证获取COSMIC癌症突变数据,包括编码突变、基因普查、突变特征、融合、拷贝数、表达与耐药突变,支撑生信分析与精准肿瘤研究。
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Data Commons 客户端
datacommons-client
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
156
提供 Data Commons 的 Python 客户端,可解析实体、查询人口、经济、健康等公共统计数据,并结合 Pandas 处理观测记录,适合探索知识图谱中的统计关系。
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NGS 数据可视化利器
deeptools
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
181
deepTools 提供命令行 Python 工具链,可将 BAM 转为标准化覆盖、完成 QC(指纹、相关、PCA)、比对样本,并绘制 ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq 的热图与轮廓等可视化,支持常见流程模板。
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DNAnexus 云基因组集成
dnanexus-integration
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
412
通过 DNAnexus 云基因组平台开发 app/applet、管理 FASTQ/BAM/VCF 等数据、运行工作流,并使用 dxpy 自动化脚本,支撑生物医学流水线。
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DrugBank 数据洞察
drugbank-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
439
提供 DrugBank 的药物与靶点数据访问,涵盖数据下载、信息查询、药物相互作用网络、靶点与通路分析以及化学相似性比较,支持药理研究与临床安全评估。
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Ensembl基因组数据库接口
ensembl-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
413
通过 Ensembl REST API 获取 250+ 物种的基因注释、序列、变异、同源基因及装配坐标映射,便于整合入基因组研究流程。
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科学数据探索分析
exploratory-data-analysis
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
414
自动识别 200+ 科学数据格式,提取元数据、评估数据质量、推荐可视化方案,并生成 Markdown 报告,帮助科研人员在后续分析前全面把握数据结构与特征。
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FDA监管数据查询
fda-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
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通过 Python 调用 openFDA 接口查询药品、器械、食品、兽药及物质的监管、召回、安全与上市信息,辅助合规分析与药物安全研究。
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