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学术论文可复现报告包构建指南
jleo-replication-package
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
134
本指南旨在指导作者如何为学术论文构建一套完整、高度可复现的报告包,尤其适用于依赖复杂机构数据的学科(如法律经济学)。内容涵盖如何从原始数据源头(如法院记录、合同)到最终展示结果,建立端到端的分析流程,并强调文档化数据构建过程、固定随机种子和数据来源出处,确保研究结果的可重现性。
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数据透明化与可复现性政策指南
jmf-transparency-and-data-policy
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
317
本指南详细介绍了向《婚姻与家庭期刊》(JMF)投稿时的数据共享和透明度要求。它专门解决了受限使用的数据集难题,指导研究人员如何在不直接发布原始数据的情况下,记录数据获取的访问路径,确保研究的可复现性。
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机器学习实验设计与审计指南
kdd-experiments
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
245
这是一份关于撰写高水平机器学习论文实验部分的全面指南。文章详细介绍了“四轴证据计划”(质量、规模、效率和机制),并强调了数据卫生和实验设计的严谨性。它指导用户如何避免时间泄漏、使用矩阵化方式记录消融实验,从而确保研究成果在学术上具备高度的可信度和可复现性。
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沉浸式计算可复现性规范
percom-reproducibility
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
333
本规范指导沉浸式计算领域的研究人员,确保基于传感数据的研究成果具有高度的可验证性和可复现性。它要求严格记录数据集可用性、传感数据来源(设备、标注、预处理),并强调跨主体评估和研究论文与实际数据之间的一致性,确保研究成果的科学严谨性。
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数据透明与研究可复现性指南
popdevr-transparency-and-data
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
317
本指南详细介绍了向《人口与发展评论》(PDR)提交稿件时,关于数据透明度和研究可复现性的各项高标准要求。内容涵盖了撰写数据可用性声明、使用FAIR存储库、记录代码版本以及处理受限数据的详细流程,确保研究成果具备高度的严谨性和可追溯性。
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系统文献检索与综合分析
revedres-literature-synthesis
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
476
本流程指导用户如何进行严谨的系统性文献综述和Meta分析,特别适用于教育研究。它强调了研究证据的可靠性和可重复性,涵盖了从多数据库的系统检索、双人独立筛选、记录PRISMA流程,到构建结构化的数据提取集和最终的综合分析。
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数据、代码和材料可及性检查
sci-data
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
469
本指南用于确保科学论文达到最高的重现性标准。它要求作者系统地记录所有必要的科学数据(如基因序列、蛋白质结构)、将自定义分析代码存档并获取DOI,以及详细说明独特试剂和材料的共享计划。这是保证研究结论可靠性的关键步骤。
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SIGIR可复现性指南
sigir-reproducibility
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
498
本指南提供信息检索(IR)研究的可复现性最佳实践,适用于SIGIR等学术会议的论文撰写。它指导作者如何精确记录数据集版本、索引构建参数、模型调优细节和随机种子等关键信息,确保研究结果的科学严谨性和可重复性。
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学术开放科学与可复现性
usenixsec-reproducibility
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
357
本指南旨在指导作者完成顶级安全会议要求的“开放科学附录”。它不仅要求系统性地列出所有研究成果物(代码、数据集、配置),更强调记录实验环境、版本依赖和数据生成流程,确保研究结果可以被独立、可信地复现。
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网络会议可复现性指南
webconf-reproducibility
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
294
本指南为依赖于动态网络数据(如网页抓取、API或实时系统)的学术研究提供可复现性规范。它定义了三种数据复现难度等级,指导作者如何诚实报告数据衰减问题,包括记录时间切片规则、环境版本和计算随机种子,确保研究结果的严谨性和可信度。
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基因组快速生物信息学搜索工具
gget
affaan-m/ECC
468
gget是一个强大的命令行和Python工具包,用于快速、可重复地在主要的基因组参考数据库(如Ensembl、UniProt)中进行生物信息学搜索。它能让用户快速查询基因元数据、执行初步的BLAST/BLAT比对,并探索相关通路、癌症或疾病模块。该工具尤其适用于初始的数据探索和生成可重复的证据记录,而不是复杂的生产级流程。
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基因变异注释与HGVS规范化
annotating-variants
maziyarpanahi/openmed
500
该技能用于将原始基因组变异标识符(如VCF、HGVS、rsID)转化为富含注释、可预测后果的记录。它集成了Ensembl VEP和gnomAD等开源工具,用于预测变异后果、映射基因组坐标并附加人群等位基因频率。同时,它能将分子发现与OpenMed提取的临床和表型上下文关联,构建完整的科研报告。
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