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高级分子控制

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RDKit 是 Python 化学信息学库，支持读取/写入分子、描述符计算、指纹、子结构搜索、反应变换与 2D/3D 可视化，适合药物发现与计算化学研究。

Umap 可视化工具

sickn33/antigravity-awesome-skills

Umap 提供一致性流形近似的降维与可视化能力，适合从复杂高维数据中提取结构，在 2D/3D 布局中探索嵌入关系。

RDKit 化学信息学工具包

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基于 Python 的化学信息学工具包，提供分子精细控制能力：SMILES/SDF 解析、分子描述符（分子量、LogP、TPSA）、指纹、子结构检索、2D/3D 坐标生成、相似性计算、化学反应与可视化，适用于药物发现与计算化学研究。

UMAP 非线性降维工具

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使用 UMAP-learn 进行快速、可扩展的非线性降维，适用于二维/三维可视化嵌入、聚类预处理、监督与半监督 UMAP、DensMAP、AlignedUMAP 及参数化 UMAP 工作流，并包含关键参数调优指南。

CellProfiler 显微定量分析

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运行可复现的 CellProfiler 流程，对二维荧光显微 TIFF 图像进行细胞核分割、细胞计数和逐对象荧光定量，支持批量执行、分割叠加图与质控检查。

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