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NCBI基因查询助手
gene-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
273
通过 E-utilities 或 Datasets API 查询 NCBI Gene,按符号或 ID 获取 RefSeq、GO、定位、表型等信息,支持批量检索与注释分析。
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GEO基因表达提取器
geo-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
252
连接NCBI GEO仓库,通过Entrez搜索GSE/GSM/GPL/Profiles,获取基因表达数据、实验设计和矩阵文件,配合GEOparse下载分析所需的转录组资料。
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GWAS目录访问
gwas-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
424
通过 GWAS 目录网页或 REST 接口查询 SNP 与性状关联,获取研究、变异、性状信息及统计结果,支撑遗传流行病学与多基因风险模型研究。
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人类代谢物数据库查询
hmdb-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
345
通过 HMDB 检索 22 万余条人类代谢物信息,可按名称、ID、结构、疾病、标本筛选,获取化学、临床、通路和谱图数据并批量下载,支持代谢组学研究与生物标志物分析。
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KEGG REST 工具集
kegg-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
279
提供 KEGG REST API 的 Python 工具,涵盖数据库信息、列表、检索、搜索、ID 转换、关联与药物交互,帮助完成通路与基因组分析。
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系统性文献综述
literature-review
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
393
系统执行文献回顾,跨PubMed、arXiv、Semantic Scholar等数据库检索、汇总主题发现、核实引文并生成带AI图示的Markdown/PDF格式报告,适用于论文、综述或研究背景整理。
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代谢组学工作台API
metabolomics-workbench-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
308
通过 REST API 访问 NIH 代谢组学工作台,获取代谢物、RefMet 规范命名、质谱 m/z 检索与研究数据,支持生物标志物与代谢组学分析。
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OpenAlex科研文献数据库
openalex-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
306
借助 OpenAlex 客户端查询 2.4 亿+ 学术成果,执行文献检索、引用追踪、开放获取发现与计量分析,覆盖论文、作者、机构等实体。
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开放靶点数据库平台
opentargets-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
157
通过 Open Targets GraphQL API 查询靶点-疾病关联、可成药性、安全性、药物及多组学证据,帮助完成治疗靶点发现、优先级排序、安全评估和药物再利用等工作。
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PDB结构浏览器
pdb-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
411
通过 RCSB PDB 搜索蛋白或核酸结构、下载 PDB/mmCIF/Binary 坐标文件、获取实验元数据并批量处理,为药物发现、蛋白工程和结构生物学提供数据支撑。
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PubMed 数据库访问
pubmed-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
226
通过 PubMed 的 REST/API 接口构建布尔、MeSH 查询,按类型和时间等属性过滤文献,并借助 NCBI E-utilities 自动抓取摘要、引用和批量处理。
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Reactome 通路分析助手
reactome-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
369
调用 Reactome 内容与分析服务(或 reactome2py 客户端)获取通路层级、基因映射、富集/表达分析与疾病机制数据,辅助系统生物学研究。
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