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STRING蛋白互作查询
string-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
261
通过调用 STRING REST API 查询蛋白互作网络、映射标识符、生成带证据着色的网络图,并对蛋白列表执行 GO/KEGG/Pfam 富集,支持跨物种分析与网络扩展。
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UniProt数据库接口
uniprot-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
249
通过 UniProt REST API 搜索蛋白质、获取 FASTA 与注释、执行 ID 映射并流式下载,适合 Python 工作流和批量分析。
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ZINC 可购化合物数据库
zinc-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
303
通过网页或 CartBlanche API 查询 UCSF 维护的 ZINC22 2.3 亿+ 可购化合物,按 ZINC ID、SMILES、供应商或随机抽样获取结构与分子库,辅助虚拟筛选与对接准备。
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BindingDB 亲和力查询
bindingdb-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
413
通过 BindingDB 的 REST 接口或下载表格获取药物-靶标的 Ki/Kd/IC50/EC50 亲和力数据,辅助靶点驱动的药物发现、SAR 分析、先导化合物评估和基准数据集构建。
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cBioPortal癌症基因组数据
cbioportal-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
131
通过 cBioPortal REST API 查询 TCGA、GENIE 等肿瘤研究的突变、拷贝数、表达和生存数据,可用于癌基因验证、共突变模式分析与临床变量关联研究。
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gnomAD 变异频率查询
gnomad-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
367
通过 gnomAD 的 GraphQL 接口获取人群等位基因频率、基因约束分数与 LoF 注释,支持罕见病变异解读与耐受基因识别。
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GTEx 表达数据探索
gtex-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
368
通过调用 GTEx 门户和 API 获取组织特异的基因表达、eQTL、sQTL 及变异调控数据,帮助解释 GWAS 位点并探索 54 种组织中的基因调控模式。
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InterPro蛋白注释工具
interpro-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
416
通过 InterPro REST API 与 Python 示例快速查询蛋白家族、结构域、功能位点等信息,支持功能预测、结构域组合分析以及 GO 注释,服务于蛋白组注释或进化研究流程。
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JASPAR转录因子结合位点工具
jaspar-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
259
通过调用 JASPAR API 和 Python 工具,获取 TF 结合模型、将 PFM 转为 PWM 并在 DNA 序列中扫描高置信度的结合位点,辅助调控变异注释、ChIP/ATAC 解读及转录因子网络构建。
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君主计划疾病知识库
monarch-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
258
通过 Monarch Initiative API 查询跨物种的疾病-基因-表现型关联,用于罕见病基因发现、表现型映射与模型生物数据整合的研究。
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全面食物营养查询
food-database-query
sickn33/antigravity-awesome-skills
120
该技能面向营养规划,支持查询、比较、推荐、份量换算、烹饪影响修正等功能,在 50 种常见食材数据库中快速定位适合各类饮食需求的营养信息。
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