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PDB结构浏览器
pdb-database
K-Dense-AI/claude-scientific-skills
130
通过 RCSB PDB 搜索蛋白或核酸结构、下载 PDB/mmCIF/Binary 坐标文件、获取实验元数据并批量处理,为药物发现、蛋白工程和结构生物学提供数据支撑。
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妥协指标威胁分析
analyzing-indicators-of-compromise
mukul975/Anthropic-Cybersecurity-Skills
501
本技能用于对IOC(如IP地址、域名、文件哈希)进行多源威胁情报分析。通过查询VirusTotal、AbuseIPDB、MISP等系统,评估指标的恶意程度、所属威胁活动,并确定阻断或监控的优先级,是安全事件响应和威胁溯源的关键步骤。
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OpenCTI威胁指标富集管道
building-ioc-enrichment-pipeline-with-opencti
mukul975/Anthropic-Cybersecurity-Skills
157
本技能指导构建基于OpenCTI的自动化威胁指标(IOC)富集管道。使用OpenCTI的STIX 2.1模型和内置连接器,从VirusTotal、Shodan等多个外部情报源拉取深度上下文信息。管道能够自动富集新摄入的指标,关联已知攻击者和活动,并生成置信度评分,辅助分析师提升优先级。
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Biopython 生物信息学工作流
biopython
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
418
提供 Biopython 工作流,用于序列操作、FASTA/GenBank/PDB 文件解析、系统发育分析、BLAST 自动化、结构分析,以及通过 Bio.Entrez 访问 NCBI/PubMed。
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科学论文数据与代码可用性指南
cell-data
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
303
本指南详细介绍了科学论文中数据和代码可用的标准化要求,旨在确保研究结果的可重复性。它指导用户将原始数据和分析代码存入如GEO、PDB、Mendeley Data和Zenodo等认可的公共存储库,并提供了撰写标准化“三点声明”的格式,确保投稿流程的规范性和完整性。
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数据和代码公开可用性指南
molcell-data
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
246
本指南详细介绍了科学论文中数据和代码公开可用性的标准流程。它指导用户了解不同类型数据(如测序、结构、蛋白质组学)应在哪些官方存档库(如GEO、PDB、PRIDE、Zenodo)进行归档,并提供了期刊要求的标准化声明格式。遵循此指南可以确保所有研究数据和代码具有可追溯性和可复现性。
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数据与代码公开可及性要求
pnasnexus-data
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
343
本文档遵循开放科学原则,指导研究人员满足期刊强制的开放数据和代码公开要求。需将所有原始数据、分析代码和图像等材料存入公共、可追溯的存储库(如Zenodo、GEO),并使用DOI或登录号进行引用,杜绝仅使用“可应要求获取”的声明。
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数据、代码和材料可及性检查
sci-data
brycewang-stanford/Awesome-Journal-Skills
469
本指南用于确保科学论文达到最高的重现性标准。它要求作者系统地记录所有必要的科学数据(如基因序列、蛋白质结构)、将自定义分析代码存档并获取DOI,以及详细说明独特试剂和材料的共享计划。这是保证研究结论可靠性的关键步骤。
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UniProt 蛋白质数据库 API
uniprot-database
sickn33/agentic-awesome-skills
181
通过 REST API 访问 UniProt 蛋白质数据库,支持按基因、登录号或物种检索蛋白条目、获取 FASTA 序列、在 Ensembl/RefSeq/PDB 等数据库间映射标识符、自定义返回字段并流式下载大规模数据集。
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1
语言
简体中文
English