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DeepTools：高通量测序数据分析工具

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

DeepTools是一个完整的命令行工具集，用于分析高通量测序数据。它支持对ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq等多种实验进行质量控制（QC）、数据标准化、样本比较和高质量的可视化图谱生成。核心功能包括BAM文件到bigWig的转换，以及生成基因组区域的热图和谱图。

单细胞RNA测序分析流程

K-Dense-AI/scientific-agent-skills

该技能提供了一个完整的单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析流程。它指导用户完成从数据质量控制、归一化、降维（PCA/UMAP/t-SNE），到细胞聚类和标记基因识别等所有关键步骤，是进行生物学探索性研究和生成高质量图表的必备工具。

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